Facteurs génétiques impliqués dans la variabilité de la glycémie et de l'insulinémie chez l'homme. Rôle du locus IGRP. – IGRP-QTL

RESUME PROJET – Contexte scientifique et objectifs: La glycémie est un trait métabolique majeur dont la variabilité est importante en physiologie (état post-absorptif, grossesse) et pour prédire plusieurs formes de diabète (gestationnel et type 2). La variabilité interindividuelle de la glycémie dépend plus ou moins fortement de facteurs génétiques. Ceux-ci ont déjà été recherchés par plusieurs génome scans dans des cohortes d'adultes de diverses populations. L'analyse de liaison a indiqué diverses régions chromosomiques avec des LOD scores à environ 1,0-3,0.
Notre objectif est de contribuer à identifier les facteurs génétiques influençant la glycémie et l'insulinémie, spécifiques d'individus jeunes et Caucasiens, en utilisant le modèle de l'obésité juvénile où la glycémie est maintenue normale par une hypersécrétion d'insuline. Des résultats préliminaires positifs tout récents (liaison de la région 2q24-32 D2S142 et association au locus IGRP en 2q24) vis à vis de la glycémie ont guidé notre démarche pour élaborer ce projet.RESUME PROJET – Description: Notre projet repose sur l'étude de la région 2q24-32 (fine mapping) que nous avons trouvée liée à la glycémie chez de jeunes obèses (LOD 3,00), et sur l'étude du locus IGRP au sein de cette région (microséquençage, haplotypes). Ce locus IGRP est original pour la génétique de la glycémie et du diabète de type 2 ou gestationnel. Nous étudierons aussi (fine mapping Illumina) les régions 7q et 17q trouvées liées à la glycémie par des LOD scores supérieurs à 2.
Nous caractériserons les polymorphismes du locus IGRP, nous étudierons l'association de plusieurs variants d'IGRP avec la glycémie et l'insulinémie dans plusieurs cohortes (jeunes obèses, femmes enceintes, adultes).Nous avons déjà avancé dans la démonstration de l'association d'un variant codant de l'exon 5 d'IGRP, Val219Leu, avec la glycémie (P=0.0001). Nous comptons renforcer et étendre cette observation à d'autres cohortes (environ 2000 jeunes obèses, 1000 femmes enceintes, 2200 adultes).
Nous étudierons l'interaction de variants d'IGRP avec les allèles d'autres polymorphismes (VNTR du promoteur du gène insuline, KIR.6.2 E/K). Nous avons prévu d'étudier de grandes cohortes pour analyser ces combinaisons alléliques .
Comme il est essentiel de démontrer l'activité fonctionnelle des variants trouvés associés à la glycémie ou à l'insulinémie, nous caractériserons les propriétés fonctionnelles de ces variants, notamment Val219Leu, en utilisant des lignées de cellules béta (HIT.T15, NIT1, alphaTC1) transfectées transitoirement avec les cDNA des deux allèles 219Val/Leu d'IGRP. Selon les données des études d'association avec la glycémie et l'insulinémie, d'autres variants codants ou régulateurs d'IGRP seront étudiés dans ces modèles cellulaires. Nous avons établi une technique permettant de quantifier grâce à un plasmide rapporteur l'activité enzymatique glucose-6-phosphatase d'IGRP dans les cellules béta transfectées. Nos premiers résultats avec cette technique sont encourageants.RESUME PROJET – Resultats attendus: 1) identification de nouveaux QTLs de glycémie sur 2q24-32, 7q, 17q par fine mapping. A noter que 2q24-32 a été trouvé associé à des traits de diabète de type 2 par d'autres équipes (mais pas de gène candidat identifié par ces équipes).
2) caractérisation des SNPs au locus IGRP, description des haplotypes et du déséquilibre de liaison entre SNPs
3) étude d'association de ces SNPs et de ces haplotypes d'IGRP avec la glycémie (à jeun et après HGPO) et l'insulinémie correspondante dans trois types de cohortes: jeunes obèses, femmes enceintes, adultes d'âge moyen. Ces phénotypes sont intéressants car la glycémie et l'insulinémie y ont une grande importance physiopathologique.
4) caractérisation fonctionnelle des variants d'IGRP par transfection dans des lignées de cellules béta démontrant le rôle biologique des variants trouvés associés à la glycémie ou l'insulinémie.
5) (pas dans ce projet) extension de ces observations