Développement du CRB de l'Institut Curie par le renforcement du système d'information permettant l'annotation des spécimens biologiques dérivés de tumeurs avec des données d'analyses génétiques, dans une perspective de valorisation et d'assurance qualité. – CRB-IC

RESUME GLOBAL PROJET CRB – Presentation generale du projet
Le Centre de Ressources Biologiques (CRB) de l'Institut Curie, initié en 1990, rassemble huit collections d'échantillons biologiques comportant notamment 50.000 échantillons tissulaires de tumeurs humaines, 8000 échantillons d'ADN constitutionnels et d'acides nucléiques extraits de tissus tumoraux, et près de 50.000 échantillons de sérum. Environ 2.500 nouveaux échantillons tissulaires sont enregistrés chaque année. Ces collections sont liées par une application informatique commune, permettant la visualisation simultanée, pour chaque patient, des spécimens disponibles dans l'ensemble des banques. Le dossier clinique est intégralement informatisé et des données codées, cliniques, histopathologiques, d'imagerie médicale et de biostatistique sont gérées dans des bases distinctes. Une application informatique originale, spécifiquement développée pour la valorisation du CRB, permet l'interrogation simultanée de ces différentes bases. Les spécimens biologiques cryopréservés peuvent ainsi être sélectionnés sur des critères de nature diverse, notamment clinique.
Une politique active de recherche translationnelle a été initiée par l'Institut Curie au cours des dernières années, portant notamment sur les tumeurs gynécologiques, les sarcomes et les tumeurs oculaires. Ces travaux, coordonnés par le Comité Décisionnel du Transfert, font largement appel aux collections du CRB.
La comparaison de la qualité globale de notre CRB avec celle de 5 autres centres européens de référence dans le domaine de la recherche translationnelle nous a amenés à définir 3 priorités pour le renforcement de notre action :
-La constitution d'une banque de sérums systématisée est indispensable pour assurer le développement des applications cliniques découlant de la caractérisation des altérations génétiques des tumeurs. Une collecte systématique devra comporter au minimum deux prélèvements réalisés avant et après le traitement.
-La nécessité de la mise en place d'une application informatique permettant le suivi exhaustif des projets impliquant le CRB a été fortement ressentie. Cette application, intégrant le contexte clinique, devra permettre d'assurer le suivi des projets initiés, des prélèvements utilisés, et des données scientifiques acquises. L'outil, élaboré conjointement par les Services Informatique et de Bio-informatique et le CRB, pourra être mis en place dans un délai de deux ans.
-Etant donné la multiplicité des ressources, le nombre croissant de nouveaux échantillons, et le développement de programmes de recherche générant d'importantes quantités d'information, un renforcement des procédures d'Assurance Qualité du CRB est indispensable.
Le financement sollicité vise à atteindre ces trois objectifs dans un délai de deux ans. La dotation sera également partagée entre les développements informatiques et la rémunération d'un équivalent temps plein, chargé d'assurer l'élaboration et le suivi des procédures d'Assurance Qualité ainsi que le suivi de la collecte des sérums.RESUME GLOBAL PROJET CRB – Nature collections, demarche QA, systeme d'information
Huit collections d'échantillons biologiques sont identifiées dans différentes Unités du Département de Biologie des Tumeurs de l'Institut Curie. Les plus importantes sont une collection de 50.000 échantillons tissulaires correspondants à environ 20.000 tumeurs différentes et de 15.000 spécimens de tissus non tumoraux, une collection de 8.000 échantillons d'ADN constitutionnels et d'acides nucléiques extraits de tissus tumoraux, et une collection de 50.000 échantillons de sérums.
Ces collections sont gérées par des applications informatiques de format similaire, permettant une visualisation simultanée des échantillons disponibles dans chacune des banques pour un même patient. L'application est en interface avec le dossier clinique informatisé. Pour la collection de tissus, les échantillons sont liés aux données anatomopathologiques les caractérisant,