– POLARHICELL

Objectifs et Résultats attendus: Le but de ce projet est d'élucider les mécanismes moléculaires mis en jeu dans la polarisation, la migration et l'invasion cellulaire. Nous proposons d'appliquer une stratégie d'étude systématique maintenant accessible en biologie cellulaire afin d'étudier le rôle de grandes familles de protéines dans ces processus, et plus généralement de produire une carte d'annotation fonctionnelle pour chacune de ces protéines. Projet Les grands projets de génomique et de protéomique alliés aux cartes d'interaction systématique ont produit une quantité importante de données qu'il faut maintenant annoter fonctionnellement. La vitesse et la qualité avec lesquels cette annotation peut être mise en œuvre dépendent fortement de la capacité qu'aura la biologie cellulaire de passer à la vitesse supérieure et d'adapter son débit à cette nouvelle nécessité. Des révolutions technologiques, l'interférence ARN et l'imagerie sous-cellulaire à haut débit, permettent cette montée en régime. Les groupes partenaires du projet proposé ici vont partager leur savoir faire, leurs modèles et leurs outils afin de relever le défi du haut débit et tirer parti de la structure de cribles cellulaires que nous avons mis en place dans le Département de Transfert de l'Institut Curie. Cette structure est équipée d'une station de travail TECAN automatisant culture cellulaire, incubation, transfection et immunofluorescence, et d'un InCell1000 capable de prendre rapidement des images en microscopie de fluorescence et d'analyser ces images de façon autonome en utilisant des algorithmes dédiés. Cette puissance de crible, alliée à l'interférence ARN, va être mise au service de l'étude du rôle de grande familles de protéines et de certains de leurs partenaires fonctionnels dans le trafic membranaire, l'organisation de microtubules, la migration et la polarisation cellulaire. Le rôle de ces protéines dans d'autres fonctions cellulaires de bases sera aussi identifié afin de produire une annotation fonctionnelle aussi complète que possible. Nous avons débuté la mise en place de banques de siRNA ciblant l'ensemble des petites GTPase, l'ensemble des kinésines, l'exocyste et nombre de ses partenaires et les partenaires des protéines CLIP. D'autres familles de protéines seront ajoutées à cette collection au cours du projet (+TIPs, SNAREs). La plateforme de crible cellulaire permettra d'identifier rapidement les meilleurs candidats régulant la polarisation et la migration cellulaire et chacune des équipes sera chargé de l'étude fine de ces protéines. Ce projet devrait permettre d'obtenir rapidement une annotation fonctionnelle de grandes familles de protéines, et d'identifier leur rôle dans les phénomènes de polarité et migration cellulaires ce qui représentera une source d'informations importante pour des projets de biologie cellulaire et de biologie du développement, mais aussi pour l'étude de dérèglements pathologiques.