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Tester l'hypothèse interactions biotiques vs. stress abiotiques dans un contexte évolutif – E-SIASH
Pourquoi observe-t’on certaines espèces uniquement dans certains habitats et non pas dans d’autres? Cette question fondamentale et l’importance relative des interactions interspécifiques et de l’environnement abiotique font l’objet de débats scientifiques depuis Charles Darwin. Malgré l’importance majeure de cette question, les hypothèse associées souvent 1) n’incorpore pas l’impacte des dynamiques évolutives rapides et 2) n’ont pas été testées expérimentalement.
Archives secrètes de la basilique de Nicée à partir des sédiments du lac d’Iznik – BASILIZNIK-SECRETS
ARCHIVES SECRETES DE LA BASILIQUE DE NICEE A PARTIR DES SEDIMENTS DU LAC D’IZNIK
Un projet inter- et transdisciplinaire pour étudier les collaborations dans les sciences de la durabilité – COLLAB2
Si l'essor des collaborations constitue une tendance actuelle majeure dans les sciences de la vie, la manière dont elles influencent les pratiques de travail des chercheurs et de leurs partenaires reste méconnue. <br />COLLAB² entend offrir une vision à la fois large et approfondie de ces collaborations, à partir d’une étude dans trois dispositifs où elles jouent un rôle majeur : les zones ateliers (ZA), les observatoires hommes-milieux (OHM) et les réserves de biosphère (RB).
Identification à l'échelle du génome des sites de fixation à la base exacte des ligands de l’ADN G4 – NEMESES
Développement d'outils de biologie chimique pour révéler les fonctions biologiques des structures secondaires d’ADN de forme G-quadruplex. A terme ce projet vise à dévoiler la formation et l'accessibilité des G-quadruplexes pendant les différentes phases du cycle cellulaire et leur rôle dans la régulation de la réplication, de la transcription, de la traduction et de la réparation de l'ADN.
Piégeage du phosphore : contribution des bactéries magnétotactiques dans les zones de transition oxique-anoxique – PHOSTORE
Le projet découle de notre récente découverte d'un groupe de bactéries magnétotactiques accumulant fortement du P à l'interface oxie-anoxie dans la colonne d'eau du lac Pavin (Massif Central, France; Rivas-Lamelo et al. 2017), ferrugineux et stratifié. Ces bactéries constituent un modèle nouveau et pertinent pour étudier le cycle du P par les microorganismes en milieu d'eau douce, les mécanismes moléculaires de séquestration du P et leur influence par les paramètres environnementaux.
Utilisation de nouveaux inhibiteurs sélectifs pour décrypter le métabolisme lipidique et de la virulence chez M. tb – LipInTB
La tuberculose (TB) causée par Mycobacterium tuberculosis (M.tb) reste la maladie infectieuse la plus mortelle au monde. Malgré un traitement antibiotique de 6-9 mois, l'apparition de souches résistantes amplifie l'incidence de TB conduisant à un échec thérapeutique et à la mort ; nécessitant l’identification de nouvelles cibles et approches.
Structure et fonction moléculaire du pseudopilus dans la sécrétion de protéines par lla voiè de type 2 – SYNERGY_T2SS
Synergy_T2SS vise à déterminer la relation structure-fonction du pseudopilus, partie motrice du système de sécrétion de type II, chez trois bactéries modèles. Les modèles actuels de sécrétion – ‘piston’ et ‘vis d’Archimède’ – prédisent des différences au niveau de la dynamique du pseudopilus et de ses interactions avec le substrat sécrété. Par des approches intégratives, nous allons tester ces prédictions afin de proposer un modèle unifié de sécrétion de type II, validé expérimentalement.
Démarche d'Optimisation pour des Systèmes Complexes Attractifs et duRables – OSCAR
Méthode d'optimisation de systèmes attractifs et durables
Simulations par schémas d'ordre élevé du transport et de la turbulence dans un tokamak – SISTEM
Simulations d'ordre élevées du transport turbulent dans les tokamaks pour la fusion par confinement magnétique
Modélisation de la hiérarchie entre descripteurs cardiaques par apprentissage automatique – MIC-MAC
L’apprentissage de représentation et en particulier l’apprentissage non-supervisé permettent la découverte de connaissances et la stratification de risque dans des bases de données médicales, mais doivent résoudre des points clés en termes d’intégration de données. Les descripteurs de données sont nombreux, peuvent être de haute dimension et de types hétérogènes, et leur combinaison n’est pas triviale. MIC-MAC vise à améliorer substantiellement l’analyse des images médicales sur ces aspects.
