Projets financés
Analyse fonctionnelle d'une nouvelle voie de répression transcriptionnelle, dépendante de petits ARNs, et ciblant préférentiellement les régions génomiques à évolution rapide chez les plantes. – NERDPATH
Chez les eucaryotes, la compaction de la chromatine en une structure connue sous le nom d'hétérochromatine est impliquée dans plusieurs fonctions telles que la transmission des chromosomes, la répression des gènes via des mécanismes de régulation épigénétique, ou la suppression de la recombinaison.
Hérédité épigénétique transgénérationnelle chez les ciliés : mécanismes et conséquences évolutives – INFERNO
Des petits ARN sont très souvent utilisés chez les eucaryotes comme ‘système immunitaire’ du génome permettant le contrôle des éléments transposables. Ils sont aussi impliqués dans des phénomènes d’hérédité non mendélienne chez des organismes très divers. Nous proposons d’utiliser le cilié P. aureli
Dynamique du protéome endocytaire : une perspective systémique du trafic et de la maturation. – DYNOTEP
L’endocytose joue un rôle clé dans la nutrition et la signalisation cellulaire et des dysfonctionnements de ce processus sont associés à diverses pathologies incluant cancers et maladies neurodégénératives. L’identification de nouvelles pistes thérapeutiques visant à pallier ces dysfonctionnements n
Mécanismes de protection de l’intégrité du génome au cours de la réplication – RepliCare
Les défauts de réplication représentent une source majeure d’instabilité génétique, à l’origine de plusieurs pathologies humaines comme le cancer. Ce projet vise à mieux comprendre comment les cellules contrôlent l’activation des origines et stabilisent les fourches de réplication en conditions de c
Formation et Intégrité des chromosomes paternels dans le zygote – ZygoPat
Le développement de la presque totalité des animaux débute lors de la formation du zygote qui réunit les noyaux de l’oeuf et du spermatozoïde. Cette étape cruciale pour l’embryon est longtemps restée ignorée et demeure encore relativement mal connue. En particulier, le noyau du gamète mâle qui trans
Approche intégrée des voies de sécrétion de la cellule épithéliale mammaire: adaptabilité de la matière grasse laitière – MilkChEST
Le projet exploite un matériel biologique unique : la chèvre, espèce dans laquelle une invalidation naturelle du gène spécifiant la caséine alphaS1 (CSN1S1) a révélé une relation étroite entre mécanismes de biosynthèse et sécrétion des micelles de caséine et des globules gras (GG). Les animaux «déf
Exploration des mécanismes de radiotolérance de l’archée Thermococcus gammatolerans par des approches génomiques et protéomiques innovantes – GAMMATOLERANS
Thermococcus gammatolerans a été isolée d’une source hydrothermale sous-marine. Cette archée est l’organisme le plus radiorésistant qui soit connu. Elle supporte une dose de 30 kGy de radiolyse pulsée sans aucune létalité. Caractériser les mécanismes impliqués dans sa radiotolérance extrême permet d
Recombinaison méiotique dans le contexte de la chromatine et de l’organisation nucléaire – MeiChrono
Des défauts de la recombinaison méiotique sont à l’origine de l’infertilité ou de maladies génétiques, comme la trisomie 21. Il a été montré qu’un nombre suffisant d’échanges est important, mais également un bon positionnement de ces échanges le long des chromosomes pour assurer le bon déroulement d
Les transcriptomes bactériens primaires et maturés pour décrypter les réseaux de régulation – ReadRNA
Le transcriptome correspond à l’ensemble des molécules d’ARN d’une cellule dans une condition physiologique donnée. Les études de transcriptome via les technologies de tiling-array et de RNAseq ont permis de quantifier de très nombreux gènes et d’identifier de nouveaux transcrits comme des ARN régul
Régulation de la maturation et de la dégradation de l'ARN par les ARN antisens – asSUPYCO
Les petits ARN non codants jouent des rôles essentiels dans la régulation de l’expression génétique chez tous les organismes vivants. Chez les bactéries, ces petits ARNs sont impliqués dans l’adaptation aux changements environnementaux, la réponse aux stress ou encore la virulence. Ils agissent le p
Analyse de l’héritabilité des traces épigénétiques dans la reproduction clonale – methylclonome
Les marques épigénétiques sur le génome relèvent d’une hérédité non mendellienne parce que leur transmission sur un nombre limité de générations n’est pas reliée à des mutations ou des changements dans les séquences d’ADN. Essentiellement ces marques sont induites par l’environnement, initient le r
Couplage entre le réseau transcriptionnel de l'auxine et l’identité florale – AuxiFlo
La compréhension des mécanismes moléculaires contrôlant l'organogenèse est la question centrale de la biologie du développement. C'est également un des verrous pour la production de variétés de plantes mieux adaptées à une utilisation ou à un environnement spécifique. Chez les plantes, l'organogen
Voies de signalisation des strigolactones (et/ou de dérivés) chez les plantes terrestres – StrigoPath
Les Strigolactones (Sls) répriment le démarrage des bourgeons axillaires. Ces molécules étaient déjà connues pour leur rôle dans des interactions symbiotiques et parasitaires. Ce projet vise à caractériser les voies de signalisation des SLs et les mécanismes de perception des SLs sur deux modèles, u
Complexes de rétrotransposition du LINE-1 humain et instabilité génomique – RETROGENO
Les éléments mobiles, tels que LINE-1, contribuent à l'instabilité de nos génomes. Malgré cela, de nombreuses étapes de la mobilité sont encore méconnues. L’objectif de notre projet est de mieux caractériser le mécanisme de rétrotransposition dans les cellules humaines en identifiant les facteurs qu
G-quadruplexes : structures et fonctions – G-QUAD
- Demontrer la formation in vivo de structures G quadruplexes, en particulier leur rôle dans la réplication et l'instabilité génétique - Etablir la structure RMN de plusieurs G quadruplexes - Identifier des ligands G quadruplexe spécifiques Mise en évidence de l'instabilité des premières séquence
Les déterminismes du volume cellulaire, un caractère complexe au croisement entre métabolisme et cycle cellulaire – Deep-in-Size
Du fait de leur relative simplicité, les eucaryotes unicellulaires comme la levure ont été des outils précurseurs pour l’étude du contrôle de la taille des cellules. Chez cet organisme, des études génétiques ont permis l’identification de nombreux mutants plus petits (whi) ou plus gros (lge) que les
De la Génomique du Genre Gallus à l'histoire de la domestication du poulet – DomestiChick
Ce projet a pour ambition de changer d’échelle dans l’approche moléculaire de la domestication du poulet en réalisant le séquençage du génome entier de plusieurs espèces. L’histoire de la domestication du poulet est mal connue à l’échelle du génome, particulièrement vis-à-vis des différentes espèces
Les systèmes NADP-thiol cytosoliques dans la signalisation oxydative chez les plantes – CYNTHIOL
Malgré de nombreuses études, on ne comprend que très mal les mécanismes impliqués dans la signalisation associée à l’oxydation cellulaire provoquée par des composés comme l'H2O2. Des modifications au niveau du statut thiol-disulfure, régulées par les systèmes NADPH-glutathion et NADPH-thiorédoxines