Organoid-based assays for functional personalized medicine strategies

L’ambition du programme ORGANOMIC est de développer des tests cellulaires pour une médecine personnalisée de type fonctionnelle qui viendrait compléter ou étendre les approches génomiques actuellement utilisées en cancérologie. Le projet vise à développer des tests fonctionnels basés sur les organoïdes dérivés de tumeur de patients (PDO) et de tester leur bénéfice clinique.

Le consortium a pour objectif de miniaturiser; automatiser et standardiser les tests de médicaments réalisés pour chaque patient sur un avatar de leur tumeur. Une stratégie basée sur la technologie microfluidique (MF) a été choisie et le travail débutera par deux cancers digestifs: le cancer colorectal (CRC) et le cancer du pancréas (PDAC). Dans l’attente de la signature de consortium permettant l’échange de matériel biologique entre partenaires, la mise en place des protocoles a été initiée. 

Le design des puces microfluidiques a été optimisé et les protocoles de mise en culture de PDO sur ces puces ont été déterminés. Les conditions de test phénotypiques font l’objet du travail en cours et permettront de quantifier la réponse des organoides à différents médicaments: les chimio et thérapies ciblées (chimiogramme) et l’immuno-oncologie (Immunogramme).

Ensuite, des tests pronostiques sur PDO dans un stroma de substitution permettront d’étudier les indicateurs dynamiques des capacités prolifératives et invasives de chaque tumeur, dans le but de distinguer les cancers indolents des cancers agressifs.

L’utilité clinique de ces tests fonctionnels sera évaluée dans le cadre de l’essai clinique Organotreat. Le premier segment, organotreat-01, vise à déterminer la faisabilité et l’efficacité d’une médecine personnalisée basée sur un chimiogramme pour les patients présentant un CRC réfractaire. Cet essai a été ouvert en 2022 et a déjà recruté 80 % des patients prévus.