Augmenter l'efficacité des oligonucléotides antisens – PROMOTE-ASO

Les AntiSense Oligonucleotides (ASOs) sont des molécules thérapeutiques prometteuses pour traiter des maladies génétiques. Malgré leur potentiel, des défis subsistent. Un premier criblage CRISPR réalisé par le consortium a permis d'identifier des protéines régulatrices de l'efficacité des ASOs. Le consortium a ainsi identifié WDR91, protéine de maturation endosomale (Menchon et al., en revue). Le consortium a également identifié plusieurs autres candidats par des études protéomiques (Gaci et al, en préparation).
Le projet Promote-ASO a pour objectifs de valider, puis caractériser des protéines candidates identifiées par un second crible CRISPR plus robuste et qui a utilisé un ASO moins toxique (permettant de diminuer les artefacts). Compte tenu de nos données préliminaires qui ont identifié des candidats spécifiques aux lignées cellulaires et au contexte, nous nous concentrerons sur l'identification de candidats communs à diverses modalités de traitement (TSB, SSO et GM) mais aussi à divers systèmes cellulaires (des lignées cellulaires génériques, aux lignées cellulaires musculaires comme les cellules DMD (Duchenne Muscular Dystrophy) et aux lignées cellulaires cancéreuses). Le consortium prévoit d'utiliser des modèles cellulaires variés et de mesurer des résultats tels que la survie cellulaire et l'expression génique, tout en cherchant à améliorer l'index thérapeutique des ASOs dans des modèles animaux.
Le projet se décompose en trois tâches :
1. Validation des protéines candidates : Identification de protéines communes à divers systèmes cellulaires et modalités de traitement.
2. Validation dans différents systèmes : Expériences de perte et de gain de fonction pour confirmer l'impact des candidats identifiés sur l'efficacité des ASOs in vitro, puis in vivo.
3. Caractérisation des mécanismes d'action : Étude des interactions des ASOs avec les protéines candidates et suivi de leur dynamique intracellulaire.