Les systèmes de défense dans les intégrons : des armes bactériennes dans une banque ? – DEFINBANK

Les intégrons sont des systèmes génétiques bactériens comprenant une intégrase et une matrice de cassettes de gènes dont l'expression diminue avec l’éloignement des cassettes du début de la matrice. Le stress active l'intégrase, entraînant la capture et le mélange de ces cassettes. Les modifications concomitantes de l'expression de ces cassettes permettent d'explorer diverses combinaisons phénotypiques. Les intégrons mobiles, portés par des plasmides conjugatifs, disséminent des cassettes de résistance aux antibiotiques à travers les agents pathogènes bactériens. Il a été suggéré que ces intégrons puisent leurs cassettes dans des énormes réservoirs de cassettes portés par des intégrons chromosomiques. Nous ignorons la plupart des fonctions de ces derniers ainsi que les taux d'échanges de cassettes au sein et entre les intégrons. Ici, nous proposons d'intégrer des analyses expérimentales et computationnelles à grande échelle pour l'étude fonctionnelle de toutes les cassettes de l'intégron chromosomique modèle de Vibrio cholerae. Notre hypothèse est que les intégrons codent de nombreuses fonctions soumises à des pressions de sélection, telles que celles exercées lors des interactions antagonistes avec les bactériophages, les bactéries et d'autres organismes. Ce projet se concentrera sur l'étude de cassettes codant pour de nouveaux systèmes impliqués dans ces processus, sur l'élucidation de leurs mécanismes moléculaires et sur la compréhension de la dynamique de brassage des cassettes et de leur dissémination parmi les intégrons mobiles. Enfin, nous étudierons si le nouveau mécanisme de recombinaison de cassettes, que nous avons récemment découvert, favorise l'échappement des cassettes des intégrons en faveur de leur stabilisation par domestication génomique. En dévoilant systématiquement les fonctions et la dynamique d’échange des cassettes d’intégrons, ce projet apportera un nouvel éclairage sur ces systèmes génétiques abondants et énigmatiques.