Rôle de la RNase J2 et des ARN régulateurs dans le choix du mode de vie de Bacillus subtilis et de Staphylococcus aureus – BaSaLS

La bactérie du sol Bacillus subtilis (B.s) et la bactérie pathogène Staphylococcus aureus (S.a) sont apparentées et peuvent changer de mode de vie (cellules motiles, biofilms et spores) pour s'adapter à leur environnement. De plus, elles peuvent coexister en milieu hospitalier dans un biofilm mixte, protégeant S.a. de l'action des biocides. Ces différents mode de vie requièrent des programmes d'expression génique spécifiques. Les RNases et les ARN régulateurs (ARNreg) sont des régulateurs post-transcriptionnel clés de l'expression des gènes. Chez B.s. et S.a., les principales RNases de la maturation et de la dégradation des ARN sont l'endoribonucléase Y et l’exoribonucléase J1. Ces deux organismes possèdent aussi un paralogue de la RNase J1, la RNase J2, dont le rôle précis reste à déterminer. Des travaux antérieurs suggèrent que la RNase J2 a un nombre limité de cibles ARN chez B.s et S.a, mais qu'elle joue un rôle important dans la virulence et la formation de biofilms chez d'autres bactéries pathogènes telles que Streptococcus mutans. Cependant, les mécanismes de régulation du mode de vie par la RNase J2 restent à déterminer chez B.s et S.a. Le projet BaSaLS vise à explorer le rôle de la RNase J2 dans le contrôle du choix du mode de vie chez B.s et S.a, y compris dans les biofilms mixtes. Nos résultats préliminaires chez B.s montrent que l’absence de la RNase J2 stimule la formation de biofilms et que J2 est un régulateur positif du niveau de c-di-GMP, une molécule de signalisation clé dans le choix du destin cellulaire bactérien. Ce projet vise aussi à comprendre le mécanisme de cette régulation et la spécificité étroite de la RNase J2 par rapport à la RNase J1 dans les deux organismes. Enfin, les ARNreg jouent un rôle clé dans la régulation des décisions relatives au mode de vie bactériens et peuvent moduler l’accès des RNases en modifiant la structure de l'ARNm cible lorsqu’ils s’apparient. Leurs rôle dans ces mécanismes sera étudié chez B.s et S.a.