Régulation de la transcription inter-TAD à longue distance par les enhancers dévelopmentaux – DevLoop

Les enhancer développementaux sont essentiels à l'expression des gènes, car ils déterminent des patrons d'expression spatio-temporels des gènes très précis. Lorsqu'ils sont situés à de grandes distances génomiques, les enhancers forment une boucle de chromatine avec le promoteur de leur gène cible. Des études récentes suggèrent que les interactions entre les enhancers et les promoteurs sont limitées à de grands domaines de proximité tridimensionnelle accrue, appelés domaines d'association topologique (TAD). Cependant, nous avons récemment démontré que des interactions fonctionnelles entre promoteurs et enhancers peuvent également se produire sur de grandes distances et au-delà des limites des TADs. Malgré leur importance, les mécanismes moléculaires régissant ces boucles enhancer-promoteur inter-TAD à longue distance et leur impact sur la régulation de la transcription dans un embryon en développement restent à étudier. Dans ce projet, nous proposons de disséquer comment les interactions enhancer-promoteur inter-TAD sont établies et contribuent à l'expression des gènes en (1) identifiant les mécanismes moléculaires régissant les interactions enhancer-promoteur inter-TAD, et (2) en quantifiant comment ces mécanismes affectent la cinétique de la transcription. À cette fin, nous utiliserons le locus twist dans des embryons de drosophile comme système modèle et tirerons parti d'une vaste collection de lignées de drosophile, de données préliminaires et d'outils développés par les partenaires.