Apprendre des systèmes toxine-antitoxine : Le silençage génique par ARN dans les bactéries – OMERTA

Les bactéries codent des gènes de suicide leur permettant de déclencher leur suicide au profit de la population. Ce sont par exemple des systèmes toxine-antitoxine (TA), qui fonctionnent dans le cadre de la défense contre les phages ou de l'addiction aux plasmides. Leur régulation est particulièrement critique car toute erreur d'expression, qui serait létale, doit être strictement évitée. Leur inhibition repose sur plusieurs niveaux de contrôle. Dans les systèmes TA de type I (TA T1), l'antitoxine est un petit ARN qui empêche la traduction de l'ARNm de la toxine en interférant avec la liaison au ribosome ou en déclenchant la dégradation de l'ARN. Cependant, d’autres niveaux de régulation, directement dépendant de la structure de l'ARNm de la toxine, sont indispensables pour empêcher les fuites d'expression de la toxine. Bien que quelques ARNm de toxines de type I aient été caractérisés, il manque une vue d'ensemble de la manière dont le silençage génique est orchestré par les déterminants ARN intragéniques des ARNm des toxines de type I.
L'objectif du projet OMERTA est de déterminer les mécanismes de silençage génique par l'ARN en effectuant une caractérisation systématique des gènes toxiques chez les bactéries. Pour atteindre cet objectif, nous utiliserons des approches bioinformatiques et génétiques, combinées au séquençage de nouvelle génération.
En résumé, ce travail constituera la première exploration systématique des systèmes ARN TAT1 et élargira notre connaissance sur le silençage génique par l’ARN. OMERTA révélera des mécanismes atypiques de régulation de l'ARN, posant les bases pour la création de nouvelles biotechnologies.