Imagerie Multiplexe par spectrométrie de masse basée sur des aptamères – Click-Detect

L'immunohistochimie (IHC) combinée à la microscopie à fluorescence constitue un outil important et largement utilisé par les biologistes et les pathologistes pour visualiser de multiples biomarqueurs dans des échantillons de tissus. Cependant, l'IHC multiplex utilisant la microscopie à fluorescence standard est généralement limitée à 3-5 biomarqueurs différents, les méthodes hyperspectrales ou multispectrales étant limitées à 8. Cependant, la technologie Tag-mass liée spectrométrie de masse a déjà démontré, via l’utilisation d’une sonde associée à un lien photoclivable à la longueur d’onde du laser et d’un rapporteur peptidique, la capacité d'effectuer des analyses multiplex permettant la détection en même temps de protéines, de transcrits et de glycanes (MALDI-IHC). Ce concept a maintenant été étendu à plus de 100-plex via les sondes Miralys. Cependant, outre la possibilité de cribler plusieurs marqueurs en un seul test, il est également important de développer une nouvelle technologie MALDI-IHC hautement spécifique, sensible, rapide, flexible, et hautement multiplexée, et dont le coût de production est limité. L'objectif de Click&Detect est de développer une nouvelle génération de tests basés sur des sondes aptamères modifiées pour la détection par spectrométrie de masse (MS) sur tissus. Le projet sera organisé autour de 4 objectifs spécifiques qui seront i) le développement des sondes aptamères modifiées en utilisant la chimie bioorthogonale pour permettre l'ajout du rapporteur (Tag) pour la détection MS par chimie click, ii) la validation des Aptamers tags obtenus et l’amplification du signal iii), le développement du test sur tissu en utilisant ces aptamères modifiés et iv) la validation sur une pathologie. En utilisant des Tags marqués isotopiquement stables, il sera possible d'obtenir un multiplexage élevé tout en gardant une flexibilité et sans avoir besoin d'acheter un instrument particulier pour réaliser le test.