Identification de cibles et de molécules antibiofilms – BIOScreenTarget

La résistance aux antibiotiques est une menace majeure pour la médecine (OMS, 2020) et 80 % des infections bactériennes impliquent un biofilm, communauté microbienne hautement tolérante contre tous les types d'agents antimicrobiens. Dans un tel contexte clinique, il faut envisager de développer des modèles adaptés, de nouvelles stratégies et/ou molécules pour traiter les infections dues au biofilm. Notre hypothèse de recherche est qu'un modèle in vitro dédié reproduisant les principaux facteurs de l'environnement osseux, ceux qui influencent la structure du biofilm lors d’infections ostéoarticulaires (IOA), révélera des caractéristiques particulières de ces biofilms aidant à l'identification des mécanismes essentiels du biofilm. Ce modèle in vitro permettra le criblage de différentes stratégies d'antibiofilm. Notre objectif est de lutter contre le biofilm des IOA par : 1) des observations à moyen et haut débit d'une collection de souches cliniques de S. aureus pour identifier les caractéristiques « spécifiques » du biofilm du contexte osseux et créer une base de données regroupant les potentiels cibles antibiofilms ; 2) de cribler une banque de molécules naturelles, de dérivés de quinolones synthétiques et de peptides antimicrobiens dans ce même modèle. Les deux objectifs conduiront à mettre en évidence des molécules ayant une forte affinité envers des cibles identifiées grâce à l'amarrage moléculaire in silico et à l'approche MicroScale Thermophoresis (MST) et/ou à améliorer des molécules existantes pour prévenir ou traiter les IOA.
L'identification de cibles ou de molécules d'antibiofilm dans un modèle IOA adapté et reproductible développé comme un outil de criblage aidera la communauté scientifique à mieux déchiffrer les biofilms dans le IOA et facilitera le transfert des modèles in vitro vers les modèles in vivo. De nouvelles stratégies thérapeutiques verront le jour pour diminuer le risque infectieux survenant après une chirurgie orthopédique.