Détection de virus via l'ARN double brin – VDOSAGE

L'ARN double brin (ARNdb) est une caractéristique de la grande majorité des infections virales. Il est produit par les virus à ARN pendant la réplication et par les virus à ADN lors de la transcription convergente. Bien qu'il soit en grande partie unique aux virus, les approches centrées sur le dsRNA pour la détection et la surveillance des virus sont largement sous-explorées. L'objectif principal de VDOSAGE est de prouver que la surveillance des ARNdb est un moyen facile, quantitatif et spécifique pour la surveillance des virus dans les organismes vivants, y compris les arthropodes et les plantes. En exploitant les remarquables propriétés de liaison à l'ARNdb de la protéine B2 du virus Flock house et de Nanobodies (Nbs) à développer ayant une haute affinité pour l'ARNdb, nous proposons de construire un dispositif portable de pointe pour la quantification ultrasensible de l'ARNdb par résonance plasmonique de surface (dsSPR). En parallèle, nous souhaitons développer le dsNanoSeq en combinant la capture de dsRNA et le séquençage direct de l'ARN à l'aide de la technologie Oxford nanopore pour permettre l'identification en temps réel des virus. Une fois optimisés en laboratoire, le dsSPR et le dsNanoSeq seront validés avec des plantes cultivées, des moustiques capturés sur le terrain et des cellules plasmatiques humaines. Pour atteindre ces objectifs, nous nous appuierons sur le savoir-faire et l'expertise uniques de 4 partenaires: B2/Nbs, technologie dsRNA et virologie végétale (partenaire 1), virologie animale (P2), chimie analytique et biotechnologie (P3), séquençage direct de l'ARN (P4). Le projet combine des approches innovantes et multidisciplinaires pour faire face aux futurs risques éco-épidémiologiques. En outre, VDOSAGE améliorera notre compréhension des viromes végétaux et animaux, ainsi que des marques épitranscriptomiques des virus. Centré sur la perspective One Health, VDOSAGE améliorera la surveillance des virus chez l'homme, les animaux et les plantes.