Emergence Rétrovirale à la ferme – REVEatFarm

Les ?-rétrovirus oncogènes sont responsables de cancers de l'appareil respiratoire chez le mouton et la chèvre. Sporadiques, ils se manifestent aussi sous forme d'épizooties avec un taux élevé de mortalité et de transmission. L’OIE a requalifié en 2020 l'adénocarcinome pulmonaire induit par le JSRV d’émergent. Malgré leur impact économique au niveau mondial, ces maladies sont négligées avec peu ou pas de réglementation et d’épidémiosurveillance. Sans vaccin ni traitements, le control doit s’appuyer sur une limitation de la diffusion de ces virus mortels. Les objectifs de ce projet sont de caractériser la persistance et la transmission de ce virus transmis par voie aérienne et de déterminer si nous pouvons identifier un facteur viral expliquant les différences d’oncogénicité. Pour répondre à ces questions, nous nous appuierons sur notre biobanque de tumeurs d'animaux infectés par JSRV et ENTV-2 et sur des échantillons prospectifs via notre réseau de vétérinaires, d'éleveurs et de partenaires techniques. Nous étudierons la présence de génomes rétroviraux dans des échantillons environnementaux en élevage et nous quantifierons la quantité de virus excrété par les animaux symptomatiques et asymptomatiques. Nous testerons si les eaux usées ou les fèces peuvent être utilisées pour surveiller la circulation de JSRV et ENTV. La deuxième partie traitera de la nature des rétrovirus associés à une forte prévalence de cancers. Pour identifier des variants viraux ou des signatures moléculaires associées à des phénotypes de pathogénicité élevée ou faible, nous séquencerons et comparerons les virus circulants dans des troupeaux avec des cancers sporadiques ou épidémiques. Enfin, nous testerons si une modification de l'expansion clonale expliquerait la différence d’oncogénicité. Ce projet permettra d’acquérir une base scientifique indispensable à la prévention de l'émergence des ?-rétrovirus oncogènes.