Comprendre comment condensine plie les génome chromatinisés en boucles de chromatine – Condensinchromatin

L’un des grands principes de l’architecture fonctionnelle des génomes eucaryotes consiste en leur repliement en boucles de chromatine par les ADN-translocases de la famille SMC. Des études in vitro montrent que les complexes SMC fixent l’ADN nu, et forment des boucles de taille croissante au travers d’une réaction allostérique dite « d’extrusion de boucles », ATP-dépendante et encore mal comprise. In vivo, les génomes eucaryotes sont empaquetés sous la forme de nucléosomes, lesquels réduisent l’accès à l’ADN pour les facteurs de type non-histone, liant l’ADN, tels que les SMC. Nous ignorons comment les SMC fonctionnent dans le contexte de la chromatine, i.e. quand les nucléosomes potentiellement réduisent leurs accès à l’ADN. Condensin est l’ADN-translocase de type SMC responsable de la condensation mitotique des chromosomes. Nous avons collecté de robustes données préliminaires indiquant que les nucléosomes sont un obstacle à l’activité d’extrusion de boucles de condensine, in vivo. Nous avons également identifié un facteur de remodelage de la chromatine, conservé, qui permet à condensine de franchir la barrière nucléosomale et ainsi de former les boucles de chromatine qui façonnent les chromosomes mitotiques. Ce projet vise à étudier plus avant les interactions fonctionnelles entre les nucléosomes, condensine et ce facteur de remodelage de la chromatine, afin de mieux comprendre comment la dynamique des nucléosomes sous-tend l’activité de formation de boucles de condensine, et l’assemblage des chromosomes, in vivo.