Impact des éléments transposables sur les réseaux de régulation génique : application aux voies biologiques à évolution rapide chez les poissons – EVOBOOSTER

De par leur nature répétée et mobile, les éléments transposables (ETs) ont le potentiel d’accélérer l’évolution par la contribution massive et rapide de séquences régulatrices prêtes à l’usage, qui peuvent générer des nouvelles régulations géniques et modifier les réseaux de régulation de l’hôte. Ce phénomène pourrait promouvoir de manière très efficace la diversité, l’adaptation et la spéciation. Les poissons téléostéens représentent un modèle très attractif pour tester cette hypothèse, puisqu’ils montrent un niveau très important de biodiversité affectant quasiment toutes les facettes de leur biologie. De plus, les poissons contiennent dans leurs génomes beaucoup plus de familles d’éléments transposables actifs que les mammifères et d‘autres vertébrés. Dans le cadre de ce projet, nous avons pour objectif d’étudier l’impact des éléments transposables sur le développement sexuel et la pigmentation, qui sont des caractères hypervariables chez les poissons. Nous identifierons de manière systématique et analyserons au niveau fonctionnel les séquences régulatrices en cis dérivées d’ETs qui sont associées aux gènes exprimés dans les gonades mâles et femelles ou pendant le développement des cellules pigmentaires normales et cancéreuses, ou qui sont fixées par des facteurs de transcription avec des fonctions majeures dans le développement sexuel et la pigmentation. Les ARNs régulateurs dérivés d’ETs et exprimés dans les gonades et les cellules pigmentaires seront aussi identifiés et étudiés. Ce projet, qui implique deux équipes avec des expertises et des ressources complémentaires (partenaire 1, Manfred Schartl, Würzburg, Allemagne : biologie du développement sexuel et de la pigmentation ; partenaire 2, Jean-Nicolas Volff, Lyon, France : éléments transposables et variabilité génomique), va fournir des informations nouvelles sur le rôle du mobilome dans la variabilité de la régulation génique chez les organismes vivants, avec une estimation du rôle des ETs dans la promotion rapide de la spéciation et des réponses adaptatives aux changements environnementaux.