Surveillance planétaire d'agents infectieux : kits de typage et banque de données – MicroType

La constitution de profils d'identité génétique et des bases de données associées est un élément essentiel de la surveillance des agents infectieux représentant un risque biologique naturel, accidentel ou provoqué. Au cours des 10 dernières années, les équipes françaises et européennes se sont positionnées comme leader en termes de développement de techniques permettant de réaliser des empreintes génétiques à bas coût. Certaines de ces équipes ont également développé des prototypes de bases de données contribuant à cette surveillance. Ces avancées technologiques permettent d' envisager maintenant de développer des produits associés, et de contribuer à la maturation du marché. Le projet proposé vise à tirer parti de l'excellente position des équipes françaises et européennes, position acquise en particulier grâce au soutien de la défense, pour franchir un cap en termes de développement et d'innovation.
Le projet conduira à la réalisation de deux kits de génotypage au stade "maquette". Ces kits seront distribués à des laboratoires leaders d'opinion. Ces laboratoires auront le rôle de beta-testeur et contribueront à la maturation de ces produits et des marchés associés. L'un des kits ciblera l'agent infectieux "Brucella", agent étiologique de la brucellose, zoonose à impact économique majeur dans de nombreux pays. Le second ciblera l'agent infectieux Pseudomonas syringae actinidiae, pathogène de l'arbre producteur du kiwi, actuellement en émergence. Ces kits permettront de sonder deux marchés potentiels, d'une part "santé animale" et d'autre part "agronomie".
Ce projet est rendu possible par les résultats obtenus lors du projet REI (Brucella) et indirectement par un projet ASTRID (génotypage d'un pathogène végétal) qui ont permis notamment le développement des outils informatiques liés à l'internet. Ces outils viendront en soutien pour la promotion et l’utilisation des kits.
Ce projet est hautement innovant et permettra à un industriel français de se positionner en pionnier d'un domaine en émergence à la croisée entre informatique, génomique et santé globale (santé humaine, animale, végétale).