Régulation de la dynamique du protéome chloroplastique – Chloro-Pro

Dans le cadre d'un projet collaboratif (ANR Génoplante 2006; projet “GlycoChloroplast”) réalisé entre nos deux laboratoires (LPCV et EDyP), nous avons produit des outils importants pour analyser la dynamique du protéome du chloroplaste à l'échelle d'un organite entier. L'un de ces outils, encore unique, est la première base de données AMT consacrée au chloroplaste, la base de données AT-CHLORO. Cette base de données protéomiques a été générée de telle façon qu'elle peut être utilisée pour des analyses quantitatives (par exemple la comparaison de mutants ou l'impact de conditions variables de culture) en reposant sur la stratégie AMT (accurate mass and time tags).
Une autre avancée récente des laboratoires LPCV et EDyP associés au présent projet, est l'identification d'un mécanisme de régulation original pour l'import des protéines dans les chloroplastes. Dans ce processus, les protéines adressées au chloroplaste sont dans un premier temps séquestrées dans le cytosol au travers d'une interaction avec un partenaire protéique, puis, libérées dans le cytosol par un signal spécifique avant d'être importées dans le chloroplaste. Des données préliminaires indiquent que ce mécanisme de régulation pourrait contrôler différentes voies métaboliques essentielles du chloroplaste.
L'objectif de ce projet est 1) d'identifier les protéines du chloroplaste qui sont contrôlées par ce mécanisme de régulation lors de leur import dans le chloroplaste, 2) d'identifier les signaux spécifiques qui contrôlent ce mécanisme original de régulation du trafic des protéines, 3) de comprendre la signification physiologique de ce mécanisme, 4) d'utiliser les connaissances obtenues pour moduler les flux métaboliques du plaste en dérégulant certaines de ces cibles spécifiques.