Systèmes de détection et d'identification en continu d'agents pathogènes biologiques par méthode de Biologiques – GEN-EASE

L'éventualité d'une agression biologique est devenue une réalité, dont les conséquences peuvent être majeures : risques d’épidémie et grande désorganisation sociale et économique des institutions et infrastructures. Ainsi, il est capital de fournir au plus tôt une information sur les caractéristiques d’une telle agression pour les acteurs de la protection civile et les primo-intervenants. Elle permet de définir les conditions d’intervention (protections individuelles, nature des premiers secours à porter aux victimes, ...) et de gérer efficacement la crise (communication adaptée, protection des populations, établissement des zones de sécurité, …). Le projet proposé a pour objectif l'étude d'un équipement de surveillance et d’analyse biologique en continu de l’environnement, compact et sensible. Le dispositif visé permettrait la détection et l’identification de plusieurs agents biologiques simultanément, par des méthodes de biologie moléculaire, en intégrant l’ensemble des fonctions, de la collecte de l’échantillon au rendu du résultat. Les principales caractéristiques recherchées sont : - Analyse en multiplex : le système réalise est capable de détecter la présence de plusieurs agents simultanément présents dans l’atmosphère ainsi que de fournir une mesure du bruit de fond biologique global, ce qui permet d’apporter une dimension supplémentaire à l’analyse (quantification d’une charge biologique interférente, détection d’un agent biologique de nature inconnue); - Analyse en semi-continu : l’équipement est capable de réaliser plusieurs analyse sans intervention de l’utilisateur permettant ainsi de monitorer l’environnement durant le temps de l’intervention ; - Sensibilité : le système étudié permet de détecter et de quantifier de faibles concentration d’agents ; - Fiabilité et richesse de l’information délivrée : le système étudié permet d’associer au rendu du résultat la nature de ou des agent(s) détecté(s) et les concentrations associées, ainsi qu’une première caractérisation du bruit de fond biologique. Il n’existe pas actuellement un tel système dont l’étude est maintenant rendue possible par des ruptures technologiques que le consortium apporte à tous les niveaux : système global, collecte, préparation de l’échantillon de collecte, PCR microfluidique et traitement du signal adapté En matière de biosécurité, cet équipement est une réponse capacitaire, qui plus est souveraine, s’inscrivant à trois niveaux dans le dispositif de sécurité globale : - en surveillance : pour la détection d’une agression biologique qu’elle soit accidentelle ou intentionnelle ; '- en levée de doute : dans le cas d’un attentat ou d’un accident où une menace biologique est plausible ; - comme outil participant du contrôle de qualité des opérations de décontamination sur le site touché. Pour mener à bien ce projet, le partenariat mis en place s’articule autour : - de Bertin Technologies (coordinateur du projet) pour son savoir faire en analyse système et procédé de bio-collecte ; - du CEA pour son savoir faire technologique en PCR en microfluidique et pour la fabrication de sondes biologiques ; - du Laboratoire LITIS pour son savoir faire en traitement du signal. Ce partenariat est complété au niveau comité de pilotage par la Brigade de Sapeurs Pompiers de Paris, prescripteur, en tant que première unité Française de Sapeur Pompier à avoir développé une cellule mobile d’intervention Biologique.