Inventaire et ressources génétiques de virus géants à ADN dans les milieux marins sur Tara-Oceans – TARA-GIRUS

Tara-Girus est une composante importante du projet Tara-Oceans, une expédition scientifique de 3 ans autour du globe sur le schooner Tara, qui a pour but d?évaluer l?impact des changements climatiques actuels sur la vie et la société humaine par l?étude de la composition des océans et des mers du monde d?aujourd?hui. Pour ce faire, Tara-Oceans rassemble une équipe internationale, multidisciplinaire, composée d?experts de renommée mondiale en océanographie, écologie, physique, microbiologie, génomique et bioinformatique, afin de réaliser une grande première : l?exploration à grande échelle des océans et les mers incluant la biodiversité climatiquement prépondérante de la biosphère. Tara-Oceans va collecter et archiver des échantillons marins afin de mesurer la diversité microbienne, tant au plan morphologique que génétique, sur des fractions microbiennes de différentes tailles. Tara-Oceans devra ainsi implémenter les technologies les plus avancées, notamment dans le domaine du séquençage massif à haut débit ainsi qu?en imagerie biologique. Tara-Girus est basé sur une approche scientifique simple et focalisée qui fournira à Tara-Oceans la possibilité de produire des données cruciales pour un projet ambitieux de mesure à l?échelle planétaire de la diversité génétique et d?espèces des grands virus à ADN d?eucaryotes (Girus) présents dans l?habitat marin. Bien que connus pour les dommages économiques et sociaux occasionnés sur les activités humaines, ainsi que pour leur rôle dans la destruction massive de phytoplanctons photosynthétiques, importants au plan climatiques, les virus géants de l?habitat marin ont été majoritairement ignorés en raison du biais induit par les protocoles utilisés dans l?analyse de la biodiversité microbienne marine. Nous proposons donc de réaliser la première caractérisation globale de la diversité génétique et d?espèces des girus marins, qui se révèlent les composants écologiquement cruciaux les moins étudiés, ceci en utilisant les technologies de pointe de séquençage actuelles. Ce projet de recherche fondamental s?il est supporté financièrement permettra de combiner trois approches expérimentales complémentaires : (i) séquençage métagénomique, non biaisé, de novo de l?ADN des fractions "procaryotes" contenant les girus. (ii) Séquençage parallèle massif de gènes de girus amplifiés par PCR, et (iii) séquençage des nouveaux girus marins isolés grâce aux protocoles développés pour l?infection de cultures d?hôtes eucaryotes pré sélectionnés. Tara-Girus, en association avec les autres projets de Tara-Oceans et notamment celui portant sur l?étude de la diversité des protistes, va ainsi produire des données biologique sur les girus et faire la lumière sur le lien existant entre ces virus géants et le plancton eucaryote. Couplés aux mesures physico chimiques des paramètres de l?environnement marin ces études permettront une meilleure compréhension de l?impact des changements climatiques (tels que l?acidification des océans) sur les écosystèmes microbiens marins complexes.