Transgénèse et génomique pour une meilleure compréhension et utilisation de la résistance aux pathogènes chez le riz et le blé – CerealDefense

Chez le riz et le blé, les maladies ont longtemps été un problème et deviennent un enjeu majeur. La résistance aux stress biotiques est un caractère majeur qui nécessite des améliorations dans l’objectif de réduire les intrants dans différents agro-systèmes majeurs. Bien que de nombreux gènes impliqués dans les mécanismes de défense sont connus chez le riz, les éléments clés de la résistance basale restent à identifier. D’un autre côté, le large panel d’information sur les mécanismes de résistance du riz disponible pourrait être utilisé pour d’autres céréales, comme le blé, qui est tout particulièrement ciblé dans ce projet. Chez le blé, des preuves fonctionnelles de l’implication des gènes identifiés par des expériences de transcriptomique font défaut. Etant donné que les gènes régulant les systèmes de défense sont souvent communs entre espèces, il est réaliste d’envisager d’appliquer les connaissances issues du riz à d’autres céréales comme le blé. Comme étape préliminaire de la faisabilité d’un tel transfert d’information d’un système modèle à une plante comme le blé, il devient aujourd’hui important de tester notre capacité à transférer des fonctions biologiques d’une espèce à une autre.Ce projet devrait réaliser trois objectifs importants tant du point de vu fondamental qu’appliqué : (1) utiliser la génomique comparative pour identifier de nouveaux composants de la résistance basale des céréales, (2) valider dans le riz la fonction de gènes candidats identifiés dans le blé comme potentiallement impliqués dans la résistance aux pathogènes, (3) transférer au blé nos connaissances actuelles sur le riz. Ce projet devrait nous procurer la première preuve à grande échelle de transférabilité de fonction d’une espèce à une autre. Toutes les informations disponibles dans les laboratoires des partenaires du projet seront transférées sur le génome du riz pour faciliter de futures validations fonctionnelles. En se focalisant sur la résistance basale, ce projet devrait permettre l’identification de gènes conférant un spectre de résistance aux pathogènes relativement large et/ou de gènes pivots dans les cascades de signalisation du riz et du blé. Par ailleurs, si des metaQTL de résistance ont été identifiés chez le riz, ceci sera réalisé chez le blé afin de fournir aux sélectionneurs de nouveaux marqueurs de la résistance aux agents pathogènes.