Epigénétique des animaux de rente : contribution de l'épigénétique dans l'expression phénotypique de caractères d'intérêt agronomique relevant de régulations polygéniques – EpigRAni

Le projet EpigRAni vise à caractériser la contribution de l'épigénétique à la variabilité phénotypique de caractères d’intérêt économique chez un mammifère d’élevage déjà hautement sélectionné, le bovin. L'épigénétique décrit la transmission des variations de structure de la chromatine qui régulent l'expression des gènes, sans modification de leurs séquences nucléotidiques. Ces variations participent de la variabilité des caractères d’élevage et leurs mesures, à partir des nouvelles plateformes technologiques permettant le séquençage massif de millions de nucléotides à des coûts cent fois plus faibles qu’il y a seulement cinq ans, offrent la possibilité de caractériser la dynamique de l'épigénome en vue de l’utiliser comme une nouvelle co-variable dans une perspective de génétique quantitative. Cest avec cet objectif qu’EpigRAni propose de tirer bénéfice de la disponibilité dans le laboratoire du partenaire 1, de plusieurs séries de bovins adultes génétiquement identiques, générés par transfert de noyaux de cellules somatiques (clones), animaux par ailleurs fertiles et parfaitement sains. Ces animaux expérimentaux produits sans recours à la recombinaison meïotique (génocopies) permettent de comparer les différences épigénétiques individuelles d’un même génome. L’ensemble de ces différences, ou certaines d’entre elles retenues comme cibles, peuvent alors être directement corrélées aux variations des phénotypes. Cette simplification expérimentale où le génome des animaux est « égal par ailleurs « constitue un avantage scientifique qu’Epigrani utilisera dans un premier temps pour mesurer la contribution de l'épigénétique a la variabilité phénotypique, déjà analysée, des caractères d’élevage de ces animaux modèles. Dans un deuxième temps, les régions du génome les plus pertinentes quand à leur statut épigénétique seront utilisées chez des vaches laitières Holstein issues de reproduction naturelle afin de déterminer la contribution des épialléles à plusieurs caractères physiologiques de la glande mammaire ainsi qu’a des défauts d'implantation associés à une réduction de leur fertilité. Projet de recherche académique, Epigrani est donc aussi une étude pilote visant à définir un nouvel outil –omique- pour accroître l'efficacité des nouveaux schémas de sélection génomique.