Recherche de QTL par marquage SNP pour des caractères de comportement social et de production chez l’oiseau – SNP-BB

Prendre en compte le bien-être des animaux en élevage avicole implique d’améliorer les méthodes de production, mais également de choisir des individus capables de s’adapter au mieux aux conditions de production. Ainsi, l’origine génétique des animaux peut influencer leur comportement social, or celui-ci est un déterminant central de l’adaptabilité. En effet, le comportement social est un élément critique lors de l’élevage en grands groupes tels qu’on les rencontre en élevage intensif (risque de comportements agressifs, de picage…). De plus, il module de nombreux autres comportements, alimentaire, sexuel, qui sont les pivots du bien-être de l’oiseau et également de sa productivité. Le projet vise à déterminer quelles sont les zones du génome responsables de la motivation sociale chez l’oiseau et quelles sont les relations génétiques entre les caractéristiques du comportement social et les principaux paramètres de production. Le modèle utilisé sera des cailles sélectionnées de manière divergente pour leur motivation sociale depuis 47 générations. Ce modèle tout à fait original est un outil de choix pour étudier les bases génétiques de caractéristiques comportementales qui ne sont pas prises en compte dans les schémas de sélection, mais dont on peut penser qu’elles influencent les performances dans les conditions de forte densité qui sont rencontrées en élevage commercial.Les cailles issues du croisement de deuxième génération (F2) des deux lignées divergentes seront phénotypées pour les caractéristiques de comportement social, de croissance et de ponte. Une étape de détection de SNP (Single Nucleotide Polymorphism) par pyroséquençage (Système GS-FLX 454, Roche), puis le génotypage des animaux F2 par des SNP informatives (Illumina Golden Gate) permettront d'identifier les QTL (Quantitative Trait Loci) impliqués dans les caractères mesurés, et de cartographier finement les régions génomiques concernées..Les résultats attendus sont l’identification de zones du génome qui sont associées aux paramètres mesurés et des relations génétiques entre caractéristiques comportementales et paramètres d’intérêt zootechnique. L’existence de relations génétiques fortes permettrait de proposer d’intégrer des tests comportementaux simples dans les schémas de sélection. A moyen terme, ces travaux permettront de rechercher plus rapidement dans l’espèce poule les zones du génome impliquées dans ces comportements et dans les caractéristiques de production qui y sont associées. Ces travaux pourront fournir des marqueurs ouvrant la voie à l'identification des mutations en cause, éventuellement utilisables en sélection, ainsi que des candidats qui permettraient d’étudier les mécanismes biologiques impliqués dans les comportements, la croissance ou la production d’œufs.