RECHERCHE DES GENES EN CAUSE DANS LA CAPACITE DE DIGESTION ET LA PRODUCTION DE REJETS DES POULETS DE CHAIR – CHIEF

La production avicole a été très largement critique pour son impact négatif sur l’environnement, en partie à cause de la forte concentration des exploitations avicoles dans quelques régions. Cela a amené l’Europe à voter des directives limitant les quantités d’azote ou de phosphore à épandre. Les solutions proposées actuellement consistent à traiter les rejets produits, ou à limiter leur quantité en modifiant des paramètres d’élevage (alimentaire ou d’ambiance). La réduction des rejets par la sélection d’animaux digérant mieux leur aliment n’est en revanche pas envisagée autrement que par l’amélioration de l’indice de consommation. En effet, la capacité de digestion de l’animal a longtemps été considérée comme indépendante de la génétique. Ce n’est qu’en 2004 qu’on a montré que la capacité de l’animal à digérer le blé était fortement héritable, et qu’ont été créées deux lignées divergentes sur ce caractère. Après 8 générations de sélection, les deux lignées présentent une capacité à digérer le blé qui diffère de 30 à 40%, et les bons digesteurs produisent environ 80% de rejets en moins que les mauvais digesteurs. Le projet CHIEF propose donc d’utiliser ce matériel unique pour rechercher les zones du génome impliquées dans le déterminisme de l’efficacité de la digestion et des rejets. Pour ce faire, un dispositif F2 sera créé à partir des deux lignées divergentes. Les animaux seront génotypés grâce à un set de 1536 marqueurs SNP. Un phénotypage fin de plus de 70 caractères liés à la digestion est proposé sur ce dispositif. Cela inclut, outre les performances zootechniques, des caractères mesurés directement sur les fientes (quantité, composition, pH), des critères d’efficacité de digestion (énergie métabolisable), des critères anatomiques et physiologiques liés au fonctionnement du tube digestif (taille des organes, histologie de l’intestin, du gésier, marqueurs de digestion), ainsi que des critères liés à l’ingestion d’énergie (comportement alimentaire) ou à l’utilisation de l’énergie et des nutriments absorbés (activité physique, métabolisme phospho-calcique, dépôt de tissu musculaire ou adipeux). Cette large gamme de critères permettra une meilleure compréhension des relations complexes entre les différents éléments de la digestion, de préciser les stratégies envisageables de sélection sur ces caractères, et enfin de suggérer des gènes candidats potentiels dans les régions QTL mises en évidence dans le projet. Ce projet repose sur l’étroite collaboration entre 3 laboratoires de l’INRA, spécialisés dans différentes disciplines (génétique, physiologie, éthologie) nécessaires à la dimension multidisciplinaire du projet. Ce projet s’appuie également sur les compétences techniques de prestataires de service pour l’analyse des rejets (CIRAD) et le génotypage (Labogena).