– Resolution-XXL

Le LPEM met au point depuis deux ans un microscope à illumination structurée dans le but de réaliser des images de fluorescence super résolues en trois dimensions. L'instrument, basé sur un microscope commercial, est actuellement en phase de tests. Les gains en résolution latéral et axial ont été démontrés indépendamment sur des échantillons simples, comme des billes fluorescentes. Le but du projet est l'obtention simultanée, sur des échantillons biologiques, d'une résolution latérale meilleure que cent nanomètres et une résolution axiale meilleure que cinquante nanomètres. Ce dispositif devra être capable de fournir des coupes tridimensionnelles d'objets biologiques complexes à une cadence supérieure au hertz. Le projet comportera deux volets : un volet instrumental ou on cherchera à optimiser un système d'illumination 3D pour pouvoir imager des objets biologiques ; un volet mathématique ou on développera les différents algorithmes de traitement des données et traitement d'images nécessaires à la reconstruction 3D temps-réel. Ce dernier volet, lié à l'imagerie mathématique, sera pris en charge par le laboratoire AIQ qui est spécialisé dans le traitement et l'analyse d'images en microscopie biologique. Il a en particulier proposé des modèles d'approximation gaussiennes des PSFs des microscopes champ large et confocaux ainsi que des méthodes ultra-sensibles de détection de spots dans des images biologiques très bruitées.