– DiSiP

Les organismes vivants ont évolués pour être capables de répondre à des fluctuations de leurs environnements comme des chocs osmotiques et des changements de températures, ou encore pour réagir à des produits toxiques ou oxydants. Pour ce faire, une cellule eucaryote doit tout d'abord détecter une telle modification dans son milieu, signaler ces changement au noyau à travers une cascade de signalisation et, finalement, transcrire un ensemble de gènes, à même de contribuer a l'adaptation ou à la réponse cellulaire. même si nombre de chemins de signalisations ont été étudié et décrit dans la littérature, il n'y a, encore, que peu d'études quantitatives concernant leurs échelles de temps intrinsèques et leur capacités de transmission d'information. Les échelles de temps, sont toutefois cruciales lorsqu'une cellule doit répondre à un changement brusque et dangereux de son environnement, comme par exemple un choc osmotique. En utilisant la levure comme organisme modèle et la cascade HOG comme chemin modèle, le projet DiSiP cherche à déterminer quelle quantité d'information un chemin de signalisation donné peut transmettre au noyau par unité de temps; quels sont les paramètres (biologiques et physiques) qui déterminent ces échelles de temps et, dans quelle mesures il est possible de modifier ces échelles de temps génétiquement. Le projet DiSiP commencera par améliorer une cellule d'écoulement prototype (mise au point récemment par le responsable du projet) pour générer dans une cellule de micro-fluidique un changement d'environnement rapide et contrôlé tout en permettant l'imagerie par fluorescence des cellules. Un tel outil, sera utilisé pour disséquer le chemin de signalisation HOG en étudiant la réponse en fréquence de cellules individuelles dans un tel environnement fluctuant. Cette étude permettra une quantification fine de l'effet de mutations bien choisies et de la concentration de certaines protéines sur la dynamique du chemin de signalisation. Le but final étant de préciser quels sont les paramètres permettant d'accélérer ou de ralentir la réponse cellulaire a un stimulus donné.