– IRMA

Les questions clé posées par le projet IRMA sont : (WP1) quels sont les éléments régulateurs de la résistance basale chez les Monocots, (WP2) quelles sont les protéines sécrétées (SFPs) par Magnaporthe grisea, dans l’apoplasme de la plante ou dans la cellule, et comment elles agissent, (WP3) quelles sont les processus utilisés par le champignon pour rendre la cellule pleinement accessible à l’invasion. Le système riz/Magnaporthe sera utilisé. La résistance basale, la sensibilité et l’action des SFPs étant intimement interconnectées, nous étudierons les interactions sous ces trois angles. Le WP1 se focalise sur la caractérisation biochimique de la protéine OsWAK32 (fonction kinase, régulation par les composants pariétaux, protéines qui interagissent). D’autres régulateurs de la résistance (subtilases, inhibiteurs de protéases, WAKs) seront aussi étudiés. Les SFPs durant l’infection sont l’objet du WP2. En relation avec le WP1, une pectine methyl esterase, des protéases à sérine et des inhibiteurs de protéase seront fonctionnellement caractérisés dans Magnaporthe. Dans une approche plus large, des SFPs seront identifiées et l’effet sur la virulence sera étudié pour 30 d’entre elles. Un système expérimental pour la localisation in planta de candidats SFPs sera développé et utilisé pour étudier 75 SFPs. Avec les marqueurs de la résistance (WP1) et de la sensibilité (WP3) identifiés, nous évaluerons l’effet in planta de ces SFPs. En utilisant le système double-hybride, nous rechercherons les cibles de 3 SFPs. Enfin, dans le WP3, les mécanismes de la sensibilité seront analysés grâce à des données d’expression. Dix gènes candidats de compatibilité (sur la base de leur annotation et de leur profil d’expression) seront caractérisés fonctionnellement. Ce projet, en plus d’identifier des fonctions nouvelles impliquées dans les mécanismes de résistance/sensibilité et de pathogénicité du champignon, permettra le développement de systèmes expérimentaux qui pourront être utiles pour d’autres interactions plante/champignon.