– FROG

Le programme de recherche FROG vise à améliorer le rendement en biomasse et/ou en grains sous contraintes abiotiques. Ce projet fait suite à un programme de Génomique végétale (AF038) au sein duquel une série de gènes candidats pour leur rôle dans la réponse aux stress de l’environnement ont été évalués à l’aide de mutants d’insertion chez Arabidopsis thaliana. Tous ces gènes candidats possèdent des homologues chez le maïs, parfois chez le blé, et sont induits en situation de stress hydrique ou salin chez le maïs ou chez arabidopsis. Sur 250 lignées mutantes testées, nous avons retenu quatre lignées qui présentent des phénotypes intéressants et différents de la lignée sauvage en conditions de stress. Nous proposons d’évaluer les effets de leur expression ectopique, nulle ou induite en conditions standards et en condition de stress sur le phénotype de plantes. Une analyse transcriptomique et une analyse physiologique adaptée à chaque gène nous permettront de situer le rôle des gènes dans les diverses voies hormonales et de réponse aux stress. De manière concomitante, la localisation dans la cellule, des protéines codées par les gènes candidats sera déterminée, ainsi que la réponse de leur promoteur à divers stimulus et au cours du développement. Des approches de bioanalyse nous guideront dans les choix expérimentaux adaptés à chaque gène étudié. L’espèce riz sera choisie afin d’y opérer un transfert des connaissances acquises par phénocopie de l’allèle favorable. Une étude de la variabilité naturelle des gènes candidats chez Arabidopsis nous indiquera qu’elles ont été les pressions de sélection exercées sur ces gènes.