NeuroLOG: technologies logicielles pour l'intégration de traitements, de données et de connaissances en imagerie médicale – NeuroLOG

Le projet NeuroLOG a pour objectif de construire un environnement logiciel en milieu ouvert pour l'intégration de ressources en imagerie médicale (données et images ainsi que modules d'analyse et de traitement de ces images) et de confronter cet environnement à des applications cibles venant principalement du domaine de la neuroimagerie et de l'oncologie. Il entend adresser les problèmes relatifs à : - la gestion et l'accès aux données semi structurées, hétérogènes et distribuées en environnement ouvert , - le contrôle des accès et la protection des données médicales sensibles , - le contrôle de flots de données impliquées dans des procédures de calcul complexes sur des infrastructures de grilles de calcul , - l'extraction et la quantification de paramètres applicatifs pertinents pour différentes pathologies. Pour atteindre ces objectifs, NeuroLOG est un projet pluri-disciplinaire qui associe des partenaires du domaine des technologies logicielles, des bases de données et des bases de connaissances et de l'imagerie médicale. Sur le plan scientifique, NeuroLOG a pour vocation de consolider et partager l'expérience acquise lors de travaux récents, et de permettre la migration de prototypes logiciels déployés dans le cadre de projets de recherche vers un environnement logiciel accessible à une communauté élargie, sur la base de contraintes exprimées et validées par une communauté d'utilisateurs venant du domaine des neurosciences cliniques et de l'oncologie. En raison de la grande diversité des sources d'imagerie et des procédures cliniques concernant leur exploitation d'une part, et de la complexité des traitements automatisés d'images médicales d'autres part, les enjeux techniques sont de taille. L'architecture logicielle établie devra être hautement adaptable et évolutive pour permettre l'intégration et l'interaction des composants techniques et métiers utilisés. Des médiateurs intégrant des fonctionnalité de description et de recherche sémantique de données de haut niveau seront nécessaires. NeuroLOG prendra en compte les besoins liés à la nécessaire protection des données médicales qui sont par nature sensibles. Il doit permettre la validation du fait que l'introduction du contrôle des accès ne nuit pas à une application de la plate-forme expérimentale dans un milieu ouvert ou tous les utilisateurs ne possèdent pas les droits requis pour l'accès aux données sensibles. Une interface avec des moyens de calcul haute performance devra être établie pour permettre le déploiement de procédures de traitement lourdes en calcul et concernant de grands volumes de données. NeuroLOG a pour ambition à long terme d'atteindre la communauté médicale, en particulier des neuropathologistes. Les enjeux économiques relatifs au domaine de e-santé sont considérables et motivent le déploiement d'un nombre grandissant de services relatifs au stockage, à l'archivage et au traitement de données médicales, au delà de ce que fournissent les systèmes actuels (PACS). D'un manière générale, un nombre grandissant de sociétés développant des outils d'analyse de données médicales ou proposant des services liés à l'archivage et à l'exploitation de ces données s'emparent de ce secteur économique. L'environnement logiciel déployé au sein de NeuroLOG permettra l'intégration de ces outils et de services applicatifs destinés à la mise en oeuvre d'applications de traitement d'images concrètes dans les domaines de la sclérose en plaque, des accidents vasculaires cérébraux et de l'oncologie du système nerveux central. Il résultera en une fédération de bases de données établies par les différents sites cliniques paticipants, permettant de constituer des ensembles d'études habituellement difficiles à réunir. L'interface avec des infrastructures de calcul de très grande taille permetra de réaliser des études systématiques et/ou nécessitant de très grandes bases de données. Un visualisateur et un outil collaboratif d'accès aux données et aux ressources de calcu