Impact de l'anthropisation et de l'environnement sur le fonctionnement des foyers de leishmanioses – IAEL

Les activités humaines influencent profondément les conditions environnementales des êtres vivants, aussi bien globalement (changements climatiques) que localement (activités agricoles et minières, déforestations). Les pathogènes subissent eux aussi ces changements, soit directement au niveau de leur diversité et distribution, soit au travers des modifications subies par leurs hôtes sauvages ou par leurs vecteurs. Ce projet est focalisé sur les leishmanioses, maladies provoquées par des protozoaires kinétoplastidés, les Leishmania et transmises par des insectes piqueurs, les phlébotomes. Elles sont largement répandues sur tous les continents, sauf en Antarctique, et représentent un problème de santé publique important dans de nombreux pays. Cependant, la biologie et la génétique des populations des agents impliqués et de leurs vecteurs demeurent encore mal connues. Ce projet a pour objectifs principaux d'étudier les effets de l'anthropisation et des modifications de l'environnement sur l'épidémiologie des leishmanioses et de corréler ces observations avec la structure génétique des populations naturelles des Leishmania et des insectes vecteurs qui les transmettent. Cette approche a pour but général d'explorer et de comprendre le mode de fonctionnement des foyers de leishmanioses dans des environnements présentant des niveaux de complexité épidémiologiques et d'activités humaines variés. Dans ce cadre, nous avons choisi plusieurs régions d'étude présentant des degrés d'anthropisation variés, des environnements et des niveaux d'endémicité différents : (i) la Guyane Française en raison de la grande variété de biotopes allant d'un environnement 100% anthropisé à la forêt totalement vierge; (ii) le Sud de la France (Pyrénées Orientales et Hérault) qui présente un biotope très anthropisé et bien connu, (iii) le Sénégal en milieu rural en raison d'un biotope moins anthropisé ou récemment anthropisé. Les objectifs spécifiques sont: (i) d'étudier l'épidémiologie des foyers de leishmaniose dans les divers environnements de Guyane Française et en fonction du niveau d'anthropisation (état du couvert végétal) par l'identification des hôtes réservoirs, l'identification des espèces de vecteurs, l'identification des espèces de Leishmania présentes, leur taux d'infection et l'évaluation du risque sur la santé humaine; (ii) d’étudier la structure génétique des populations naturelles des Leishmania en Guyane Française en fonction des différents biotopes (forêt primaire, zones de forêt plus ou moins dégradées et zones urbaines) et en fonction de la profession et l'activité des patients prélevés (agriculteur, activités urbaines, activités en forêt, etc.); (iii) d'étudier la structure des populations des espèces de phlébotomes reconnues comme principaux vecteurs. Le pré-requis à cette étude est de replacer phylogénétiquement les espèces vectrices par rapport à l'ensemble des espèces du groupe dans le monde. Cette étude permettra de réévaluer les phénomènes coévolutifs de ces insectes avec les leishmanies, leur dépendance et les risques de propagation de la maladie dans des zones actuellement indemnes; (iv) de comparer les structures des populations des pathogènes avec celles observées chez leurs vecteurs phlébotomes; (v) de comparer la structure des populations de ces parasites à celles rencontrées dans le Sud de la France, biotope très anthropisé et montrant une diversité de leishmanies, de vecteurs et de réservoirs (chiens) bien moindre que celle de Guyane ainsi qu'au Sénégal moins anthropisé et touché, entre autres, par la même espèce de Leishmania que l'Europe.