– SCLEROTINIA

Sclerotinia sclerotiorum est un champignon phytopathogène majeur du colza et du tournesol. Ce parasite se conserve plusieurs années dans les sols et devient un facteur limitant au développement des cultures sensibles dans des sols fortement infestés. La lutte fongicide vis à vis du parasite est limitée (inefficacité sur tournesol, apparition de souches résistantes sur colza). Une résistance génétique existe mais le type de résistance en jeu (partielle et polygénique) et la forte dépendance de la maladie aux conditions agro-climatiques, rendent très difficile l'exploitation de la résistance variétale par les techniques classiques de sélection. Etant donnée l'importance de ce parasite, des travaux de génomique ont récemment été engagés sur colza et sur tournesol. Ils ont permis d’identifier à la fois des QTL de résistance et des gènes candidats. L’intervention d’un d’entre eux (lectine –kinase) dans la résistance a été validé par transgénèse à la fois sur tournesol et colza (Brevet Génoplante). Sachant que plusieurs gènes sont impliqués dans cette résistance, l'objectif majeur du projet proposé est de poursuivre l'identification des gènes impliqués dans la résistance et de valider leurs fonctions. Pour cela différentes actions seront réalisées: (i) Identification de gènes candidats : il s’agira dans ce cas de compléter les études de transcriptome sur colza et d’analyser la résistance à Sclerotinia de mutants de signalisation d'Arabidopsis, (ii) Mise en place d'un outil de sélection des séquences candidates basé sur des études conjointes de cartographie et d'analyse d'expression (iii) Mise en place et exploitation d'outils de validation fonctionnelle. Un outil de validation 'haut débit' sera mis au point en analysant la résistance à Sclerotinia de mutants d'insertion d'Arabidopsis. Sur colza, la fonctionalité des gènes sera validée par transgénèse RNAi, et sur tournesol un panel de lignées intégrant notamment les ressources d’hélianthus sauvages sera constitué pour de futures études d’association génétiques.