TAG : Conception et exploitation d'une puce multi-usage du génome d'arabidopsis – TAG

L’objectif du projet est de concevoir, valider et exploiter une puce unique couvrant le génome d’Arabidopsis a l’aide de 786000 sondes réparties sur ce génome selon une série de critères permettant une exploitation versatile. La puce sera développée conjointement avec la société NimbleGen. Les données seront gérées et exploitées en s’appuyant sur un système d’information dérivé de celui développé à l’URGV pour l’analyse du transcriptome. Les applications de cette puce seront mises au point pour divers types d’expérimentations (méthylation de l’ADN, ChIP chip, RIP chip, détection et analyse de transcrits codants et non-codants, etc.) et les outils statistiques ad-hoc seront adaptés et utilisés sur la base d’une expertise acquise à l’URGV.