– SMART

L’amélioration de la qualité et du rendement du blé dans un contexte d’agriculture durable est une préoccupation internationale majeure. Des progrès significatifs dans l'isolement de gènes d'intérêt agronomique ainsi que dans la gestion et l’exploitation des ressources génétiques sont désormais nécessaires pour atteindre ces objectifs. Malgré les améliorations importantes réalisées ces dernières années en génomique du blé (construction de banques BACs, augmentation de la densité des marququrs sur les cartes genetiques, clonage positionel des premiers gènes …), l'isolement de gènes reste long et laborieux et les connaissances sur la structure et le fonctionnement du génome de blé sont encore trop limitées. Le projet présenté ici vise à etablir le Minimal Tiling Path puis à séquencer et analyser une region de 20Mb contenant plusieurs gènes impliqués dans des résistances durables à des maladies fongiques majeures (fusariose, septoriose et rouilles) situé sur le bras court du chromosome 3B de blé tendre dans le cadre d'un effort international coordonné par le laboratoire demandeur. Il s’appuie sur la construction d’une carte physique du chromosome 3B qui représente la base d'un projet de grande envergure développé dans le laboratoire coordinateur et dont le but est d’utiliser le chromosome 3B comme modèle d'étude de la structure, du fonctionnement et de l'évolution du génome de blé tendre. Les données uniques, générées par ce projet permettront d'isoler tous les gènes présents dans la région, de développer des marqueurs pour la sélection assistée des gènes de résistance, et de réaliser des études de l’organisation et de l’évolution du génome à une échelle encore jamais atteinte chez le blé. Ainsi, ce projet devrait contribuer à l’isolement de gènes d’intérêt agronomique majeurs et à une meilleure connaissance du génome de blé tout en confortant les positions de leader du laboratoire et de Génoplante dans le réseau international de génomique du blé.