– ISD STARCH

Plus de vingt d’équipes à travers le monde s’intéressent directement au métabolisme de l’amidon et environ une dizaine d’entre elles ont choisit Arabidopsis thaliana comme modèle d’étude. On comprend donc bien dans ce contexte que la compétition est relativement élevée d’autant que les découvertes concernant le métabolisme de ce polymère de réserve sont de plus en plus liées à des intérêts technologiques et donc à des prises de brevets (plus de 600 produits commerciaux dérivent plus ou moins directement de l’amidon). Le projet qui est proposé a pour objectif de renforcer nos connaissances des mécanismes de synthèse et de dégradation de l’amidon mais aussi d’établir le processus d’initiation de la synthèse des polymères et de la formation du grain (ces deux derniers points peuvent ou non être totalement indépendants). Ces objectifs seront atteints par une approche de génomique fonctionnelle liée à l’étude de lignées mutantes, mais aussi et surtout à la production et à l’analyse de combinaisons de mutations générées par croisements. Nous proposons ainsi de comprendre l’implication 1) des amidon-synthétases solubles (SS3 et SS4 en particulier) dans les mécanismes d’initiation de synthèse des polymères (de l’amylopectine essentiellement) et/ou de formation du grain d’amidon, 2) de la GBSSI et de l’amylopectine pour l’initiation de la synthèse de l’amylose, et 3) des amylases et des phosphorylases plastidiales lors de la dégradation des polymères. Par ailleurs, grâce à une forte partie concernant l’analyse du transcriptome de lignées mutantes affectées pour un ou plusieurs gènes connus du métabolisme de l’amidon, nous voulons mettre en évidence l’implication d’autres gènes pour l’instant non perçus comme nécessaires dans cette voie. Ces analyses nous permettrons aussi de mettre en évidence les gènes essentiels à la régulation des voies de synthèse et de dégradation mais aussi de percevoir les connexions avec le métabolisme du carbone en général.