Génétique de la susceptibilité à l’Influenza aviaire chez les oiseaux domestiques – GenAviFlu

La grippe aviaire est devenue récemment un problème majeur en santé animale et un risque pour la santé publique à cause du variant H5N1. Le virus responsable présente de nombreux variants et peut évoluer rapidement. La variabilité génétique de la sensibilité des oiseaux domestiques à ce type de virus est inconnue. L'objectif du projet est de mieux connaître les facteurs génétiques intervenant sur la réponse immunitaire du poulet et du canard en réponse à 2 variants H5N1, hautement ou faiblement pathogène, et en réponse à deux constructions vaccinales (herpesvirus recombinant ou vaccin inerte). L'étude portera sur 16 races ou lignées de poulet et 8 races ou lignées de canard choisies en France et au Vietnam en fonction des données pré-existantes sur leur résistance à des pathologies infectieuses, leur CMH, leur importance en aviculture. Le polymorphisme intra-race sera étudié sur 720 animaux par séquençage de 4 gènes choisis a priori pour leur rôle dans la résistance aux maladies (BF2 et TAP2 du CMH, Mx, Nramp1). Tous les animaux génotypés seront aussi éprouvés par inoculation de l'un ou l'autre variant H5N1. Les infections expérimentales seront réalisées en milieu confiné pour 10 individus par lignée, une première série comparera la sensibilité de tous les génotypes aux 2 variants H5N1. Ensuite, les mécanismes de la réponse immunitaire seront analysés par une approche transcriptomique et par RT-PCR quantitative, après infection par le variant peu pathogène, sur un sous-ensemble de lignées expérimentales choisies pour leurs réponses divergentes lors de la première série. Les résultats attendus sont la mise en évidence de différences de sensibilité à la grippe aviaire entre génotypes et l'identification des gènes dont l'expression est modifiée par l'infection et par la vaccination.