Paramétrage et validation industrielle d’une nouvelle technologie de « finishing » de génomes complexes par analyse discriminative de signature clonale (DACS) ;Application au séquençage du chromosome 7 de la tomate (Lycopersicon esculentum) dans le cadre – DACS7

Le projet vise, au travers d’un programme international, à valider et déployer une solution technologique innovante et économique, optimisant l’étape de finishing, phase ultime du processus de séquençage génomique d’organismes complexes. Deux objectifs sont ciblés : • un objectif industriel d’adaptation, de paramétrage et de validation d’une nouvelle approche technologique pour s’affranchir de manière très compétitive des difficultés majeures du finishing des génomes complexes, • un objectif scientifique, visant par la mise en œuvre industrielle de cette nouvelle approche, à soutenir et renforcer la participation française à l’initiative internationale de séquençage des génomes des Solanaceae (Solanaceae Genome Initiative, SGI), dans le respect des normes de qualité définies par le SGI, et comprenant – pour la partie française - le séquençage de 27,7Mb de BACs du chromosome 7 du génome de la tomate et l’annotation des gènes localisés dans cette région. Ce projet représente une opportunité majeure à plusieurs titres et ses retombées seront multiples, permettant : • à GENOME express d’acquérir une position concurrentielle prépondérante sur le secteur du séquençage de génomes complexes où les besoins sont extrêmement importants, et donc de s’ouvrir de nouvelles perspectives de développement économique, • la valorisation des compétences scientifiques du partenaire académique, l’enrichissement de sa productivité scientifique dans une thématique de premier plan international, en rapport avec ses axes de recherche.