Analysis of the risk of evolution from low to highly pathogenic avian influenza virus – RISKEVOL

Les virus influenza aviaires hautement pathogènes (VIAHP) dérivent de virus influenza faiblement pathogènes (VIAFP) qui ont évolué génétiquement par des substitutions ou des insertions de nucléotides dans la séquence codant pour l’hémagglutinine (HA), conduisant à l’apparition d’un séquence riche en acides aminés basiques au niveau du site de clivage de HA. Dans la nature, l’évolution vers les VIAHP a uniquement été observée chez les virus possédant une HA de sous-type H5 ou H7, suggérant que leurs séquences nucléotidiques ou leurs structures pourraient favoriser les substitutions ou les insertions de nucléotides dans la séquence codant pour le site de clivage de HA. Le risque d’évolution d’un VIAFP de sous-type H5 ou H7 vers un VIAHP est pour le moment inconnu. L’objectif de ce projet est d’étudier dans quelle mesure et par quels mécanismes la séquence nucléotidique de HA pourrait influencer l’acquisition d’un site de clivage polybasique et donc l’évolution vers un VIAHP.