Impact de l'EJC sur la localisation et l'empaquetage des ARNm – Eat_local

La localisation intracellulaire des ARNm favorise l’expression locale de protéines et est essentielle pour la polarité et la différenciation cellulaire. Nous avons identifié le premier ARNm de vertébrés dont la localisation dépend de l’EJC (exon-junction complex). Déposés par le spliceosome, l’EJC est central pour la destinée des ARNm et nos données récentes suggèrent un dépôt d’EJC spécifique selon les exons. A l’aide de lignées cellulaires éditées et des méthodologies de pointe, nous aborderons le rôle de l’EJC dans l’empaquetage et la localisation des particules mRNPs, en: 1) déterminant le code de déposition de l’EJC par une méthode sensible de CLIP-seq; 2) criblant le génome pour trouver d’autres ARN localisés dépendant de l’EJC; 3) caractérisant les effecteurs par lesquels l’EJC permet l’expression localisée; 4) examinant le rôle de l’EJC sur la conformation des ARN, in vitro par la manipulation de molécules uniques et in vivo par smFISH.