Mise en place d'une approche metabolomique ciblée à réponse rapide pour modéliser les cinétiques d'évolution des médiateurs de l'inflammation chez les patients COVID-19 au cours de leur prise en charge dans les services de réanimations. – COVID-METAFLAM

À partir de décembre 2019, un nouveau coronavirus, désigné SRAS-CoV-2, a provoqué une éclosion internationale de maladie respiratoire appelée Covid-19, nécessitant pour une petite proportion de patients, admission à l’Unité de soins intensifs (USI). Cependant, malgré les besoins urgents des directives thérapeutiques, on sait peu de choses sur la réponse immunitaire et inflammatoire exacte des patients atteints de COVID-19 et aucun biomarqueur robuste, sensible et précis n’est disponible. L’objectif principal du projet COVID-METAFLAM actuel est de caractériser la cinétique des profils inflammatoires métabolomiques associés à la réponse inflammatoire-immune pendant la pneumonie COVID-19 chez les patients atteints d’USI. Nous prévoyons également d’aider à la prédiction des phases successives (phase aigue, phase de résolution) de la réponse inflammatoire-immune; rechercher une association entre les profils métabolomiques et les résultats cliniques (morbidité, mortalité); pour se concentrer sur les profils métabolomiques chez les patients recevant des traitements immunomodulateurs, chloroquines et/ou anti-inflammatoires. Nous émettons l’hypothèse que l’intégration et la modélisation de l’apprentissage automatique des métabolomiques ciblés inflammatoires en plus des profils de cytokine et des données biocliniques devraient démontrer que certains métabolites fortement corrélés à la phase pathogène de l’infection, tandis que d’autres sont associés à la phase de résolution. Notre projet vise donc à stratifier les patients COVID-19 en fonction de leur statut inflammatoire et métabolique pour aider à la prise en charge de ces patients et pour fournir des lignes directrices pour le traitement des patients. Ce projet bénéficiera d’une expertise combinée d’équipes de médecins, de virologues, de biologistes médicaux et de biostatisticiens travaillant sur les soins intensifs et les métabolomiques/lipidomiciques. Nous porterons également une attention particulière aux essais thérapeutiques en cours utilisant des antiviraux, des stéroïdes, des immunomodulateurs et d’autres médicaments tels que l’hydroxychloroquine. Le projet durera 12 mois et sera organisé en cinq tâches : (i) Recrutement de patients et collecte de données démographiques, anamnéstiques, cliniques, radiologiques, biologiques et microbiologiques (basées sur l’étude COVID-ICU, REVA); (ii) Collecte et transport d’échantillons biologiques (basés sur l’AP-HP COVID-Biobank); (iii) Explorations biologiques; (iv) Analyse des résultats; v) Gestion de projet. Il sera soutenu par les réseaux existants : COVID-ICU Study, un Français multicentrère potentiel (70 IC, 10 ICU en région parisienne) réalisés par le réseau REVA et l’AP-HP COVID-Biobank. Au cours de la période d’inclusion de 3 mois, nous estimons que 900 patients atteints de pneumonie COVID-19 seront admis aux 10 UIC participants (30 patients/mois/centre). Parmi eux, nous estimons que 50% seront inclus dans l’AP-HP COVID-Biobank. Nous combinerons des données d’une grande variété d’origines, de données cliniques et d’imagerie (données qualitatives ou quantitatives), de résultats biologiques et de métabolomiques pour fournir un modèle statistique aux valeurs pronostiques et prédictives, comme cela avait déjà été fait dans notre laboratoire pour des pathologies spécifiques et la recherche antidopage. La coordination du projet sera assurée par URC -EST, le Centre de recherche clinique (CRC-EST), le Certified BioBank Research Center (CRB) de l’Université de la Sorbonne et l’Unité de Recherche Clinique. Notre projet est ambitieux et innovant : (i) c’est le premier projet européen qui propose une approche métabolomique pour surveiller la cinétique des médiateurs inflammatoires chez les patients atteints de pneumonie COVID-19 ; (ii) le court délai pour obtenir des résultats garantira un impact à court terme, avec une traduction rapide dans la pratique clinique et la thérapeutique.