Recrutement des bactéries symbiotiques dans la phyllosphère: mécanismes de reconnaissance, fonctions et réaffectation de symbiotes foliaires héréditaires – PHYLLOSYM

Les technologies de modification du microbiome végétal sont particulièrement prometteuses pour la gestion de la santé des plantes, mais les facteurs influençant la stabilité des associations entre plantes et microbes bénéfiques restent mal compris. Une symbiose héréditaire s’ouvrant à manipulation expérimentale entre une espèce d’igname africaine semi-domestiquée et une nouvelle espèce de bactérie offre une occasion unique de découvrir les mécanismes de recrutement et de transmission trans-générationnelle de bactéries mutualistes. Le potentiel expérimental sans précédent de cette symbiose foliaire à nodules ouvre en outre de nouvelles voies vers l’ingénierie de caractères héréditaires à travers la manipulation des symbiotes.
Tirant parti de cette symbiose modèle, je compte appliquer des méthodes de métabolomique, génomique comparative, biologie moléculaire et de synthèse pour répondre aux questions suivantes:

[1] Quelle est la base des échanges métaboliques entre bactéries symbiotiques et plante hôte dans la phyllosphère ?
[2] Quelles caractères des bactéries symbiotiques sont-ils reconnus dans la phyllosphère? A quel stade de développement la reconnaissance symbiotique a-t-elle lieu?

L’étude des symbioses foliaires est susceptible de révéler les règles de base par lesquelles les plantes négocient avec leur microbiote dans les organes aériens. En outre, la découverte de la base métabolique de la symbiose peut générer de nouvelles molécules d’inspiration biologique, avec applications possibles pour la protection des cultures.