Santé et Bio technologies Infrastructures

Transgenèse pour les Etudes Fonctionnelles sur les Organismes modèles

TEFOR

Mots-clés : modèles aquatiques ; édition du génome ; imagerie 3D ; gestion ; traitement et analyse d images

Résumé

Depuis sa création en 2012, l'infrastructure d'Avenir TEFOR s'est investie dans le développement de services distribués pour l’édition du génome et le phénotypage par imagerie, chez deux organismes modèles : le poisson-zèbre et la drosophile. L’infrastructure favorise ainsi l’utilisation de ces modèles,

notamment pour la recherche préclinique. L'essor de l'utilisation du système CRISPR/Cas9 pour l'édition du génome a constitué une véritable révolution. TEFOR s’est adaptée à ces changements technologiques rapides, et a développé des outils et services novateurs dans ce domaine. TEFOR a aussi optimisé des méthodes d'imagerie de plus en plus résolutives et/ou rapides, utilisant la clarification des tissus, et des microscopes confocaux avec objectifs adaptés. TEFOR met à disposition ces méthodologies et systèmes au profit de tiers utilisateurs pour leurs investigations et s’est engagée à mener une recherche technologique de pointe sous-tendant le développement de ces services. TEFOR a su donc s'adapter aux nouvelles innovations disponibles et se restructurer pour répondre au mieux aux besoins des communautés de chercheurs concernés.

Faits Marquants :

- Développement d'un outil en accès libre d'aide au design des sgRNA en collaboration avec l'Université de Santa Cruz) : CRISPOR (http://crispor.tefor.net/)

 

- Déploiement de bases de données interrogeables dédiées aux collections d’images 3D, en ressource libre : zebrafish.tefor.net et fruitfly.tefor.net

 

- Développement et optimisation de processus d'acquisition d'images avec diverses applications (biologie fondamentale, biomédical, éco-toxicologie, etc.)

 

- Intégration dans l'infrastructure nationale CELPHEDIA (www.celphedia.eu) et reprise des activités du Centre de Ressources Biologiques Xénopes de Rennes

 

- Pérennisation d'une partie des activités de TEFOR dans une Unité d'Appui et de Recherche (UAR) sous tutelles CNRS/INRAe/Université Paris-Saclay

 

- Labellisation Gis-IBiSA

 

L'auteur de ce résumé est le coordinateur du projet, qui est responsable du contenu de ce résumé. L'ANR décline par conséquent toute responsabilité quant à son contenu.

Informations générales

Acronyme projet : TEFOR
Référence projet : 11-INBS-0014
Région du projet : Île-de-France
Discipline : 5 - Bio Med
Aide PIA : 12 500 000 €
Début projet : juin 2012
Fin projet : décembre 2024

Coordination du projet : Johanna DJIAN-ZAOUCHE
Email : johanna.djian@cnrs.fr

Consortium du projet

Etablissement coordinateur : CNRS IDF Sud (Gif)
Partenaire(s) : Université Clermont Auvergne, INSERM Délégation Grand Ouest, INRAE Centre Ile-de-France - Jouy-en-Josas - Antony, INRAE Centre Ile-de-France - Versailles-Saclay, INRAE Centre Bretagne-Normandie, CNRS Paris Villejuif

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