Transgenèse pour les Etudes Fonctionnelles sur les Organismes modèles
TEFOR
Mots-clés : modèles aquatiques ; édition du génome ; imagerie 3D ; gestion ; traitement et analyse d images
Depuis sa création en 2012, l'infrastructure d'Avenir TEFOR s'est investie dans le développement de services distribués pour l’édition du génome et le phénotypage par imagerie, chez deux organismes modèles : le poisson-zèbre et la drosophile. L’infrastructure favorise ainsi l’utilisation de ces modèles,
notamment pour la recherche préclinique. L'essor de l'utilisation du système CRISPR/Cas9 pour l'édition du génome a constitué une véritable révolution. TEFOR s’est adaptée à ces changements technologiques rapides, et a développé des outils et services novateurs dans ce domaine. TEFOR a aussi optimisé des méthodes d'imagerie de plus en plus résolutives et/ou rapides, utilisant la clarification des tissus, et des microscopes confocaux avec objectifs adaptés. TEFOR met à disposition ces méthodologies et systèmes au profit de tiers utilisateurs pour leurs investigations et s’est engagée à mener une recherche technologique de pointe sous-tendant le développement de ces services. TEFOR a su donc s'adapter aux nouvelles innovations disponibles et se restructurer pour répondre au mieux aux besoins des communautés de chercheurs concernés.
Faits Marquants :
- Développement d'un outil en accès libre d'aide au design des sgRNA en collaboration avec l'Université de Santa Cruz) : CRISPOR (http://crispor.tefor.net/)
- Déploiement de bases de données interrogeables dédiées aux collections d’images 3D, en ressource libre : zebrafish.tefor.net et fruitfly.tefor.net
- Développement et optimisation de processus d'acquisition d'images avec diverses applications (biologie fondamentale, biomédical, éco-toxicologie, etc.)
- Intégration dans l'infrastructure nationale CELPHEDIA (www.celphedia.eu) et reprise des activités du Centre de Ressources Biologiques Xénopes de Rennes
- Pérennisation d'une partie des activités de TEFOR dans une Unité d'Appui et de Recherche (UAR) sous tutelles CNRS/INRAe/Université Paris-Saclay
- Labellisation Gis-IBiSA
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Informations générales
Acronyme projet : TEFOR
Référence projet : 11-INBS-0014
Région du projet : Île-de-France
Discipline : 5 - Bio Med
Aide PIA : 12 500 000 €
Début projet : juin 2012
Fin projet : décembre 2024
Coordination du projet : Johanna DJIAN-ZAOUCHE
Email : johanna.djian@cnrs.fr
Consortium du projet
Etablissement coordinateur : CNRS IDF Sud (Gif)
Partenaire(s) : Université Clermont Auvergne, INSERM Délégation Grand Ouest, INRAE Centre Ile-de-France - Jouy-en-Josas - Antony, INRAE Centre Ile-de-France - Versailles-Saclay, INRAE Centre Bretagne-Normandie, CNRS Paris Villejuif