Projets financés
Identification en masse des variants génétiques influençant les caractères d’élevage chez les trois principales races laitières françaises – CartoSeq
L’ANR a financé ses dernières années plusieurs projets de génomique bovine, dont le projet CartoFine. Le but de ce projet était la localisation fine de QTLs pour des caractères laitiers chez les trois principales races laitières présentes en France, Holstein, Normande et Montbéliarde. Chacun des 320
Génomique multi-race des Bovins Allaitants et Laitiers – GEMBAL
Adapter les outils et les objectifs de sélection pour gérer efficacement les productions françaises de lait et viande bovine est un enjeu majeur des prochaines années. La sélection génomique fournit une occasion prodigieuse de réorienter la sélection bovine pour un élevage plus durable. Le projet Ge
Etude comparative des génomes et des transcriptomes de Xanthomonas phytopathogènes – XANTHOMIX
L’objectif du projet XANTHOMIX est de fournir des données de génomique et de transcriptomique pour une meilleure connaissance des mécanismes d’infection, de la spécialisation d’hôte et la spécificité tissulaire, des mécanismes évolutifs et de l’épidémiologie de cinq espèces de Xanthomonas. Les Xanth
Séquençage et génomique comparative des plasmides de Escherichia coli : apport à la compréhension du succès évolutif des ß-lactamases à spectre étendu – RepliColScope
La résistance aux antibiotiques est devenue un enjeu mondial de santé publique. Une illustration en est l’explosion de la résistance acquise aux céphalosporines de troisième génération (G3G), couramment utilisées pour traiter les infections à Gram négatif. Cette résistance est principalement due à l
Comprendre la pathogenicité de Entamoeba par l'utilisation de la transcriptomique et la phylogénétique comparatives – GENAMIBE
Nous allons comparer les génomes de différentes espèces d’Entamoeba et cataloguer ainsi les gènes qui pourraient expliquer l'adaptation et le mode de vie de ces espèces (ex. commensal ou parasitaire). Ensuite, nous allons caractériser les différences au niveau de leurs transcriptomes afin d'identi
Biopuces à polysaccharides pariétaux en génomique fonctionnelle – WALLARRAY-II
Le projet WallArray a été soumis à l’appel d’offres ANR-Génomique en avril 2008. Dans ce cadre, le projet a été financé pour une étude de faisabilité sur un an. Les résultats acquis confortent les différents partenaires du projet dans les objectifs initialement proposés. Le nouveau projet s’appuie s
Développer et tester de nouveaux outils biotechnologiques pour accroître la teneur en huile de la graine : une clé pour la production de chaînes hydrocarbonées chez les oléagineux. – SOLAR
Objectifs du projet : Les huiles végétales constituent une denrée alimentaire précieuse dont la consommation augmente pour cause de croissance démographique mondiale soutenue. De plus, les acides gras végétaux stockés dans les graines sous forme de triglycérides (TAGs) ont une structure comparable
Développement d’une population NAM pour l’analyse de caractères complexes chez Brassica napus – BrassiNAM
Le colza est la culture oléagineuse la plus cultivée en Europe. La surface cultivée ne cesse de croître depuis 2003 dû au fort développement de la demande en huile de colza, à la fois pour l’alimentation humaine et pour des utilisations non alimentaires. Récemment la demande sur les produits agrico
Mise au point et valorisation d’outils de phénotypage nouvelle génération pour l’analyse des déterminants génétiques de l’efficacité d’utilisation des engrais azotés chez le blé tendre. – PHENOBLE
Afin de pouvoir répondre à la demande mondiale en céréales qui augmentera constamment dans les 50 prochaines années, le rendement, notamment du blé tendre, devra être amélioré de 2% chaque année. Ce niveau ne pourra être atteint qu’après avoir optimisé la sélection variétale et les pratiques agronom
Diversité des composants génétiques et des mécanismes de résistance à Aphanomyces euteiches chez les légumineuses. – Immunit-Ae
Aphanomyces euteiches, un oomycète racinaire des légumineuses, est le principal facteur biotique limitant de la production de pois en France et en Europe. Pour accélérer l’amélioration génétique de la résistance à A. euteiches chez cette espèce cultivée, nous nous proposons d’utiliser les ressources
Un outil générique pour la gestion et l’exploitation des résultats de génétique d’association utilisant les données de génotypage et de phénotypage hauts débits – GnpAsso
Depuis plusieurs années, de nombreux progrès ont permis l'obtention de données génomiques et génétiques à l'échelle des génomes pour les espèces de grandes cultures. Les développements en bio-informatique visant à la fois l'intégration des données et leur analyse sont de plus en plus nécessaires pou
Bases développementales, moléculaires et génétiques de l'adaptation de la vigne à la contrainte thermique. – DURAVITIS
Comme d'autres plantes cultivées, la vigne est confrontée à des changement climatiques, notamment à une augmentation de la température, peu rassurants pour ses perspectives d'évolution. Les températures élevées sont connues pour agir défavorablement sur certaines composantes du rendement (ex : initi
Étude d'association sur génome entier entre variation structurale, variation des caractères d'intérêt agronomique et hétérosis chez le maïs – CNV-MAIZE
Les variations structurales (SV) intraspécifiques des génomes, telles que les insertions, délétions, duplications, inversions et translocations, ont été jusqu’ici considérées comme des évènements rares impactant peu les variations phénotypiques. De récentes études montrent que ces SV, en particulier
Adaptation du chloroplaste aux stress abiotiques : utilisation de la protéomique pour révéler les phénotypes moléculaires – Chloro-types
L’objectif du projet Chloro-type est d’étendre notre connaissance sur le lien qui existe entre la régulation du métabolisme du chloroplaste, son adaptation aux conditions environnementales et la dynamique de la biogénèse de cet organite. Ainsi nous proposons de déchiffrer les mécanismes qui soutende
Analyse phylogénomique des duplications géniques chez les poissons téléostéens: une approche par RNA-Seq – PhyloFish
Les poissons téléostéens comptent près de 30000 espèces et représentent donc plus de la moitié des espèces de vertébrés. Toutefois, seuls quelques génomes sont disponibles, pour la plupart parmi des espèces relativement proches au regard de la diversité des espèces existantes. De plus, les poissons
Contribution du microbiote intestinal à l’homéostasie du système immunitaire chez le porc: approches génétiques et génomiques – SUS_FLORA
Une meilleure compréhension des mécanismes de résistance/susceptibilité aux agents pathogènes devient un axe de recherche prioritaire dans une perspective européenne de rationalisation des élevages, de sécurité alimentaire et sanitaire et de diminution des additifs et traitements médicamenteux. En l
Vers une Utilisation Optimale de l’Information Génomique dans les schémas pyramidaux – UtOpIGe
Ce projet vise à fournir les informations nécessaires à la mise en place d'une sélection génomique dans les schémas de sélection pyramidaux caractérisés par : un étage de sélection en race pure pour produire des terminaux croisés; un milieu de contrôle en sélection de haut niveau sanitaire en compar
Génomique evolutive et fonctionelle de biosynthèse des glucosinolates indoles modifiés – EFG-MIG
Le système glucosinolate-myrosinase est un mécanisme de défense inductible chez la plante modèle Arabidopsis thaliana et chez les espèces proches de l'ordre Brassicales. Ce système protège les plantes efficacement contre les la plupart insectes herbivores et d'autres ravageurs, en générant au moment