L’ANR a été créée en 2005 pour promouvoir la recherche française sur projets, et pour stimuler l’innovation en favorisant l’émergence de projets collaboratifs pluridisciplinaires et en encourageant les collaborations « publics-privés ». Il s’agit également de renforcer le positionnement de la recherche française au niveau européen et mondial. Les missions de l’Agence, définies dans le décret du 1er août 2006 révisé le 24 mars 2014, sont :
L’action de l’ANR vise ainsi à soutenir l’excellence de la recherche française à des degrés de maturité technologique variés, à soutenir la recherche fondamentale, à encourager les partenariats scientifiques académiques et « publics-privés », et à favoriser les coopérations européennes et internationales. Pour cela, elle propose des appels à projets compétitifs et met en œuvre des processus de sélection rigoureux basés sur l’évaluation par les pairs, qui respectent les principes internationaux en la matière : impartialité, équité de traitement, confidentialité, déontologie, intégrité scientifique, et transparence.
Depuis 2010, l’Agence est également opérateur de l’Etat pour la gestion des Programmes d’investissements d’avenir (PIA 1, 2 et 3) dans le champ de l’enseignement supérieur et de la recherche. Elle assure à ce titre, la mise en œuvre des appels à projets, l’organisation de la sélection, de la contractualisation, du financement, du suivi, de l’évaluation, et de l’impact des projets et des actions du programme qui relèvent de ce champ. Chaque programme des Investissements d’avenir fait l’objet d’une convention entre l’Etat et l’ANR, qui définit notamment les objectifs et la gouvernance.
La programmation de l’ANR est arrêtée par le ministère chargé de la Recherche et élaborée sur la base des orientations définies dans la Stratégie nationale de recherche (SNR), en articulation avec les initiatives européennes et internationales de financement de la recherche. Les comités de pilotage de la programmation (CPP) constituent les instances de consultation pour élaborer le Plan d’action qui décrit les actions et les appels à projets proposés pour l’année à venir. Feuille de route de l’Agence, il vise à offrir aux communautés scientifiques une visibilité générale de l’offre de financement de l’ANR.
Dans le cadre de sa politique qualité, l’ANR fiabilise ses procédures et procède à des adaptations continues pour garantir la qualité de la sélection, optimiser la qualité du service rendu auprès de ses publics utilisateurs, et assurer l’efficience de l’établissement et de ses activités. L’Agence est certifiée ISO 9001 pour son processus de sélection des projets.