Découverte de composés antimicrobiens dans les coproduits agro-industriels au moyen de techniques spectroscopiques computationnelles combinées à des méthodes de criblage originales – TACOSCOPY

TACOSCOPY est un projet multidisciplinaire à l'intersection de la chimie, de la bioéconomie et de la santé. Son objectif est d'utiliser des méthodes innovantes de profilage chimique et de criblage biologique pour extraire sélectivement des composés antimicrobiens de co-produits agro-industriels.
Dans un premier temps, les échantillons de biomasse seront soumis à des techniques d'extraction vertes afin de garantir une empreinte environnementale minimale et une consommation minimale de solvants d'origine pétrolière. Cela permettra de répondre à la nécessité d'utiliser des approches chimiques durables et respectueuses de l'environnement. Dans le respect de ces critères, tous les extraits produits seront fractionnés grâce à des solvants biosourcés par chromatographie de partage centrifuge, puis l'activité antibactérienne de chaque échantillon sera évaluée in vitro. En parallèle, le projet a pour objectif de proposer un nouveau processus combinant la chromatographie liquide couplée à la mobilité ionique et à la spectrométrie de masse en tandem et le profilage chimique par résonance magnétique nucléaire en s'appuyant sur des algorithmes d'apprentissage profond de pointe pour améliorer le taux d'identification des molécules en mélange complexe. La liste des structures des composés identifiés sera soumise à un procédé innovant de docking moléculaire inverse automatique sur des protéines cibles spécifiques de T. gondii et de bactéries résistantes. Toutes les données biologiques et structurelles dirigeront l'isolement ciblé des composés les plus prometteurs par des méthodes chromatographiques vertes. La CI50 des molécules purifiées sera déterminée par des tests in vitro et leur identification sera confirmée au moyen de techniques spectroscopiques utilisant l'élucidation structurale assistée par ordinateur. À terme, ce projet pourrait contribuer à élargir la chaîne de valeur de plusieurs co-produits industriels.