Maladie émergente en milieu isolé : comprendre les mécanismes de transmission pour contrôler les épidémies du riz – DEMETERice

Les épidémies constituent une menace majeure. En l'absence de traitements ou de variétés résistantes, prévenir la transmission des agents pathogènes apparait comme une solution pour limiter leur impact. Le riz est l'une des céréales les plus cultivées au monde. Cette culture est menacée par la bactériose vasculaire du riz (BLB) causée par Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo). Bien que la BLB ait fait l’objet de nombreuses études, on connait étonnamment peu le cycle de vie de Xoo. S’il est admis que le vent, l'eau et les blessures participent à sa dispersion, l’ampleur de leur contribution n’a jamais été étudiée formellement. Qui plus est, le rôle des semences dans la transmission n'a jamais été démontré. En 2019, nous avons identifié pour la première fois la présence de BLB à Madagascar, un pays où le riz représente 90% des activités agricoles. Des données préliminaires suggèrent que les semences sont impliquées dans l'introduction et la dispersion rapide de la maladie. Ce projet propose une approche multidisciplinaire combinant des expériences aux champs et au laboratoire, des aspects sociaux (pratiques agricoles, réseaux de distribution des semences) et des approches d'épidémiologie moléculaire pour comprendre les mécanismes conduisant à la dissémination d'une bactérie phytopathogène. L’épidémie de BLB à Madagascar servira de modèle car i) l'introduction récente de Xoo permettra de suivre en temps réel sa dispersion et son adaptation à un environnement contrasté ii) une île offre un système isolé intéressant pour étudier les épidémies iii) compte tenu de l'importance socio-économique du riz à Madagascar, il est urgent de générer des connaissances qui guideront un contrôle intégré de la BLB. Ainsi, ce projet vise à valider expérimentalement la capacité de Xoo à être transmis par les semences, à évaluer le rôle des semences dans la propagation de la BLB et à déterminer l'importance de la transmission par les semences par rapport à d’autres modes de transmission.