Dissection Fonctionelle de l'Adadaptation des Deltavirus vers des Hôtes Animaux – DeltAdapt

Les virus à ARN émergent représentent une menace de santé mondiale, comme en témoignent les pandémies récentes. Il est essentiel de comprendre leur potentiel d'adaptation à de nouveaux hôtes ainsi que les mécanismes moléculaires impliqués pour anticiper et atténuer de futures épidémies. Les deltavirus (DVs), petits virus satellites à génome ARN circulaire très structuré, illustrent cette menace. Jusqu’à peu, leur seul représentant était le virus de l'hépatite D (HDV) qui provoque de graves hépatites en association avec le virus de l'hépatite B. La découverte récente de virus similaires chez divers animaux et l’observation que le tropisme pourrait être modulé par une variété de virus auxiliaires soulèvent de sérieux risques de transmissions zoonotiques.
DeltAdapt vise à évaluer le potentiel évolutif des DVs et les déterminants moléculaires de leur adaptation à divers hôtes et en particulier aux cellules humaines. Nos objectifs sont d'aider à anticiper l'émergence de ces virus, d'élucider leurs propriétés fonctionnelles et d'identifier des cibles potentielles pour une inhibition à large spectre.
Nous proposons un cadre innovant intégrant 3 méthodologies complémentaires: i) caractériser l'adaptation des DV par séquençage de nombreux haplotypes génomiques au cours d'évolutions expérimentales; ii) mesurer l'impact sur les taux de mutation viraux de subvertir des polymérases hôtes à matrice ADN pour traiter des génomes ARN; et iii) programmer un criblage mutationnel profond du génome de HDV pour dégager les rôles des structures génomiques et évaluer si elles contraignent l’évolution.
S'appuyant sur les expertises synergiques de deux jeunes groupes spécialisés dans les DVs et la biologie synthétique à haut débit, cette approche multi-échelle fournira des informations inédites sur le potentiel d'adaptation des DVs et les propriétés fonctionnelles des virus à ARN structurés, permettant d'améliorer les stratégies de lutte contre les menaces virales existantes et émergentes.