Relier les fonctions aux mécanismes écologiques dans les communautés microbiennes. – LinkFM

Les communautés microbiennes, qui jouent un rôle essentiel dans le fonctionnement des écosystèmes et la santé humaine, présentent des fonctions collectives complexes résultant d'interactions non seulement entre diverses espèces mais aussi entre les espèces et les conditions environnementales. La compréhension et le contrôle de ces fonctions présentent des défis majeurs en écologie qui reflectent le manque de connaissances sur la manière dont différents mécanismes écologiques peuvent déterminer les fonctions des communautés. Cette proposition de recherche interdisciplinaire adresse ce manque de connaissances en intégrant des méthodes de physique statistique, machine learning et la microbiologie expérimentale. Les objectifs de recherche comprennent : 1)Cartographier les performances fonctionnelles des communautés microbiennes dans le contexte de la résistance collective aux antibiotiques, 2) Établir des liens entre les mécanismes écologiques et fonctions écologiques en caractérisant différentes phases de la dynamique des communautés, et 3) Développer des méthodes parcimonieuses pour évaluer les dynamiques des communautés microbiennes et leur performances fonctionnelles à l’aide d’ensembles de données accessibles. Cette recherche vise à faire progresser notre compréhension de la performance fonctionnelle des communautés microbiennes dans divers écosystèmes, en fournissant des informations essentielles pour une gestion écologique durable et des stratégies visant à atténuer les impacts des menaces microbiennes sur la santé humaine et l'environnement.