Imprinting à long terme du système immunitaire par le microbiote néonatal – ISprint

La colonisation microbienne de l'intestin est essentielle pour assurer des fonctions que l'hôte mammifère ne code pas. Ces fonctions comprennent la digestion d'éléments alimentaires complexes et la production de composés et de vitamines nécessaires, ainsi que le développement et la régulation du système immunitaire. En outre, de nombreuses recherches ont montré que l'exposition au microbiote en début de vie définit la réactivité du système immunitaire à long terme, et qu'un manque d’exposition entraîne une susceptibilité accrue aux pathologies inflammatoires et à leurs conséquences, un phénomène appelé « imprinting » immunitaire. Nous avons rapporté l'existence d'une « réaction de sevrage » immunitaire en réponse à l'expansion considérable du microbiote lorsque le jeune mammifère passe d'un régime exclusivement lacté à un régime diversifié. Si la réaction de sevrage est perturbée par l'administration d'antibiotiques ou un régime alimentaire inadéquat, les souris développent un système immunitaire qui réagit de manière excessive aux défis inflammatoires à l'âge adulte. Nous avons montré, avec d'autres, que la mémoire aux bactéries en début de vie est codée dans l'épigénétique de gènes immunitaires, à la fois dans les cellules hématopoïétiques et dans les cellules stromales résidant dans les tissus. Cependant, la nature de l'information microbienne qui modifie la régulation épigénétique de ces gènes, l'identité des cellules porteuses de cette information dans différents organes et les conséquences de cette mémoire sur les défis immunitaires locaux et systémiques restent largement inconnues. Dans ce projet, nous nous appuyons sur un partenariat productif entre immunologistes et biologistes des tissus pour explorer (i) les façons dont le microbiote modifie l'épigénétique des gènes immunitaires, (ii) la nature et la fonction des cellules imprimées par le WR, et (iii) l'impact de l'imprinting sur la résistance et la susceptibilité à la pathologie.