Rôle des fibroBLAST exprimant la PTK7 dans l'homéostasie et la pathologie du côlon – PTK-BLAST

Le dialogue entre l'épithélium colique et les fibroblastes voisins joue un rôle crucial dans la régulation de l'homéostasie et de la pathologie intestinale. L'expression de la protéine tyrosine kinase 7 (PTK7) dans l'épithélium tumoral a été associée à un mauvais pronostic dans le cancer colorectal (CRC). Les équipes Borg, Hahne et Mamessier ont identifié que les fibroblastes coliques expriment également PTK7, en homéostasie et dans les tissus tumoraux coliques. De plus, elles ont établi que les fibroblastes PTK-BLAST exprimant PTK7 ont également un rôle régulateur dans la colite. Dans ce projet, les trois équipes étendront leur collaboration et utiliseront leur expertise complémentaire pour caractériser moléculairement et fonctionnellement les différents compartiments cellulaires régulés par PTK7 dans l'homéostasie colique ainsi que dans la pathologie. Pour ce faire, les équipes utiliseront des modèles murins pertinents pour la colite humaine ainsi que des cultures cellulaires primaires murines et
humaines établies, dont les organoïdes. Ces modèles seront étudiés par des méthodes de pointe dont l'ARNseq sur un noyau unique,
la protéomique, l'immunofluorescence multiplex sur coupes de tissus et le marquage de proximité afin d'identifier les partenaires de PTK7. Enfin, les altérations identifiées seront validées sur des biopsies de patients atteints de colite ulcéreuse et évaluées, avec l'expression de PTK7, pour leur capacité à servir de biomarqueurs.
La caractérisation du dialogue épithélio-fibroblastique étudié dans ce projet pourrait être transférée à d'autres maladies inflammatoires chroniques.